1 Molekulare Zellbiologie

DNA-Replikation, Mutation, Reparatursystem, Genregulation Prokaryoten

DNA-Replikation, Mutation, Reparatursystem, Genregulation Prokaryoten


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Langue Deutsch
Catégorie Biologie
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Crée / Actualisé 15.06.2015 / 12.02.2025
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Verpackung der DNA innerhalb der Zelle

Siehe Bild

DNA-Repikation

DNA-Polymerase

Meselson-Stahl Experiment

Replikationsgabel - Was fällt auf?

DNA Neusynthese AUSSCHLIESSLICH in 5‘ --> 3‘ Richtung! 

Überblick über die bei der Replikation involvierten Proteine

Topoisomerasen: leiten den Vorgang der Entwindung ein, indem sie Einzelstrangbrüche erzeugen (nicking). Wozu dient das? Topoisomerase --> Entspannung der durch die Helikase verursachten Spannung

Helikasen: vervollständigen die Entwindung des ursprünglichen Doppelstranges.

DNA-Polymerasen: synthetisieren neue DNA-Stränge, in der Regel an einem schon existierenden DNA-Strang, der als Matrize dient. Es gibt eine Vielzahl an Polymerasen.

Primasen: synthetisieren kurze RNA-Einzelstränge, die an die DNA binden und als Starthilfe für die Polymerisierung mittels der DNA-Polymerase dient.

Ligasen: katalysieren die Bildung einer Phophodiesterbindung zwischen einer freien 3‘-OHGruppe und einer benachbarten freien 5‘-Phosphatgruppe.

Einzelstrangbindende Proteine: sind wichtig für die Stabilisierung der Replikationsgabel.

DNA-Polymerasen

Siehe Bild

Bidirektionalität der DNA Replikation (Virus SV40)

Siehe Bild

Replikation am Ende der DNA-Stränge (Telomere)

--> Problem: „lagging“ strand synthesis! Wieso ist dies ein Problem?

Telomerase:

Siehe Bild

Punktmutationen:

Punktmutationen: Veränderung einer Base

Definitionen: Ein Purin ersetzt das andere Purin oder ein Pyrimidin ersetzt ein Pyrimidin

-->Transition

Ein Purin ersetzt ein Pyrimidin oder umgekehrt

-->Transversion

Wie kommen Punktmutationen zustande?

Gewisse Wasserstoff-Atome können ihre Position innerhalb der Base wechseln. Z. Bsp. kann eine Aminogruppe (NH2) von Adenin in eine Iminoform (=NH) überführt werden. Das sogenannte Iminotautomer von Adenin kann mit Cytosin eine Basenpaarung eingehen. Das heisst, aus einer A-T Paarung kann eine G-C Paarung werden!

Anteil des Iminotautomers: 10-4

Keto - Enol Tautomerie

Siehe Bild

Chemische Mutagenese: Salpetrige Säure (HNO2; Nitrous acid) --> Deaminierung

Siehe Bild

Chemische Mutagenese: Acridine

Siehe Bild

Chemische Mutagenese: Aflatoxine

Siehe Bild 

UV-Licht induzierte Mutagenese:

Siehe Bild

DNA Reparaturmechanismen

3 Mechanismen:

- Base Excision Repair

- Direct Repair

- Nucleotide Excision Repair

Base Excision Repair

Siehe Bild

Excision Repair

Siehe Bild

Transkription Grundlegendes Konzept

Siehe Bild

RNA-Polymerase

Siehe Bild

RNA-Polymerisierung

Siehe Bild

Komplementarität zwischen DNA und RNA / Welche DNA wurde kopiert?

Siehe Bild

Start der RNA-Synthese

--> Promotor-Region, bindet RNA Polymerase und Regulatorproteine

Initiationsprozess der RNA-Synthese

Siehe Bild 

Terminierung der RNA-Synthese

Siehe Bild

Modifikation der mRNA nach der Transkription

a) Eukaryoten

b) Prokaryoten

Siehe Bild

RNA Prozessierung: RNA capping am 5‘ Ende

SIehe Bild

RNA Prozessierung: Poly-A Zusatz am 3‘ Ende

Siehe Bild

Inhibition der Transkription

Interkaliert in die DNA zwischen 2 aufeinander folgenden G-C Basenpaaren und verhindert so die Transkription

Experiment: Wie entdeckt man den genauen Ort auf der DNA, an den die RNAPolymerase bindet?

Siehe Bild

Von allen Genen in eukaryotischen und prokaryotischen Zellen ist jeweils zu einem bestimmten Zeitpunkt nur ein Teil exprimiert. Das Bedürfnis der Zellen, ein Gen zu exprimieren ist eine Funktion verschiedenster Umstände,

wie z. Bsp. Wachstumsphase, Nahrungsangebot, Temperatur etc. Da die Expression eines Gens ein energetisch kostbarer Prozess ist, sind die Transkription und die weiteren Prozesse während der Expression stark reguliert.

Gene für Proteine, die die ganze Zeit gebraucht werden, werden housekeeping Gene genannt.

Unveränderte Genexpression wird als konstitutive Genexpression bezeichnet.

Bsp. Gen für Aktin --> Zytoskelett Metabolische Gene

Regulierte Genexpression:

Genexpression kann durch sogenannte Inducers verstärkt werden Bsp. Starke Schädigung der DNA führt zu erhöhter Expression der Gene für Reparaturproteine. Genexpression kann durch Repressoren verhindert werden. Bsp. Zugabe von Mengen Tryptophan ins Medium reprimiert die Expression der Gene für die Tryptophansynthese.

Basale Level der Transkription wird durch die Promotorsequenz bestimmt, an den die RNA-Polymerase mit verschiedenen Affinitäten binden kann.

Mind. 3 Typen von Proteinen regulieren den Start der Transkription Spezifitätsfaktoren: regulieren die Spezifität der RNAPolymerase für den jeweiligen Promotor 

Repressoren: verhindern die Interaktion der RNA-Polymerase mit dem Promotor

Aktivatoren: erhöhen die Interaktion der RNA-Polymerase mit dem Promotor

a) Negative Regulation

 

Siehe Bild

b) Positive Regulation

Siehe Bild

Genstruktur in Prokaryoten

Viele prokaryotische Gene sind in sogenannten Operons organisert. Verschiedene Gene, deren Produkte (Proteine) in einem gemeinsamen Prozess gebraucht werden, sind auf dem Chromosom nahe zusammen und werden zusammen transkribiert und reguliert.

lac Operon: 

Das erste Operon, das beschrieben wurde von Francois Jacob und Jacques Monod.

Lactose als Zuckerquelle benötigt die Enzyme Galaktoside Permease und β-Galaktosidase. Diese beiden Gene werden gemeinsam transkribiert.

Lac operon

Catabolite acitvator protein

Siehe Bild

The trp Operon:

Regulation durch den Trp Repressor sowie durch Attenuation der trp mRNA.

Verhindert weitere Transkription

Siehe Bild

Erlaubt weitere Transkription

Siehe Bild

SOS-System:

Gene für die Reparatur sind über das ganze Genom verteilt, werden aber durch einen Mechanismus reguliert.