11 MZB I - Sartori
Expression der genetischen Information
Expression der genetischen Information
Fichier Détails
Cartes-fiches | 99 |
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Langue | Deutsch |
Catégorie | Médecine |
Niveau | Université |
Crée / Actualisé | 08.04.2016 / 05.05.2021 |
Lien de web |
https://card2brain.ch/box/11_mzb_i_sartoti
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Intégrer |
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Alternatives Spleissen
verschiedene Subtypen
Aus ein und derselben DNA-Sequenz und dementsprechend ein und derselben prä-mRNA können mehrere verschiedene reife mRNA-Moleküle und durch deren Translation auch mehrere unterschiedliche Polypeptide gebildet werden.
Verschiedene Subtypen:
a. Benutzen alternativer 5’ (donor) splice site
b. Benutzen alternativer 3’ (acceptor) splice site
c. Exon skipping (Ueberspringen von Exons)
d. Mutually exclusive, alternative exons (Kassettenexons)
e. Intron retention (Beibehalten von Introns)
Alternatives Spleissen:
Bsp. Fibronektin
Exon shuffling
Prinzip
homologe Rekombination
transposition
Exon shuffling is a molecular mechanism for the formation of new genes. It is a process through which two or more exonsfrom different genes can be brought together ectopically, or the same exon can be duplicated, to create a new exon-intron structure.
Grundprinzip: Viele Exons kodieren eine funtionellen Teil eines Proteins, der autonom faltet, eine sog. Domäne
Theorie: Proteinvielfalt resultiert durch Kombination (“Shuffling”) von Domänen (Exons) nach einem Baukastenprinip
homologe Rekombination:
Austausch von Exons zwischen 2 verschiedenen Genen durch homologe Rekombination (Doppel-Crossover) zwischen Alu Sequenzen (=repetitive DNA Sequenz). Resultat: 2‘neue’Gene
Transposition:
Insertion eines fremden Exons durch Transposition benachbarter homologer DNA-Transposons. Resultat: 2 ‘neue‘ Gene
Homologe Rekombination (HR)
Auftreten
Vorausstezung (auf ebene der DNA), dass HR möglich ist
Bedeutung von HR bei Doppelstrangbrüchen
• HR ist universell, tritt also bei allen Organismen auf
• während der ‘Konjugation’ in Bakterien
• während der ‘Meiose’ in Eukaryoten (sexuelle Fortpflanzung)
• Voraussetzung für HR sind Bereiche homologer (dh ähnlicher) Nukleotidsequenzen
• Bei DNA-Doppelstrangbrüchen (DSBs) kann durch HR der Schaden fehlerfrei repariert werden, indem die genetische Information auf dem unbeschädigten Chromatid als Matrize (Template) genutzt wird.
The Holliday model of DNA crossover
-> Repair of the gap can lead to crossover (CO) or non-crossover (NCO) of the flanking regions
-> wichtiger Zwischenschritt des Crossing-overs
BRCA1 und BRCA2
BReast CAncer 1 und 2
BRCA1 und BRCA2 sind Tumorsuppressorprotein (wie p53)
-> BRCA1 and BRCA2 spielen eine zentrale Rolle in der DSB Reparatur (HR) !
Breast Cancer Risk:
1 in 9 women (11%) will develop breast cancer during their lifetime !
2 in 3 women (65%) carrying a mutated BRCA1 gene will develop breast cancer !
Chronisch myeloische Leukämie
Therapie
Konsequenz von Fehlerhaftem Verknüpfen von zwei DSBs;
• t(9;22) Translokation führt zu einem verkürzten Chromosom 22 (sog. Philadelphia Chromosom)
• 95% der CML Patienten weisen ein Philadelphia Chromosom auf
• der Chromosomenbruch liegt im Bereich von 2 Genen, BCR und ABL (Tyrosinkinase)
• das Fusionsprodukt BCR-ABL besitzt dauerhafte Kinase-Aktivität (onkogene Wirkung)
• die Zelle vermehrt sich unkontrolliert (unabhängig von Wachstumsfaktoren) und entartet
• Der Wirkmechanismus von Imatinib besteht in der kompetitiven und selektiven Blockade der ATPBindungsstelle der BCR-ABL Kinase. Damit wird die Übertragung eines Phosphatrestes auf das Substrat (Kinasierung) wird verhindert.
• Imatinib ist das Paradebeispiel für die “gezielte Krebstherapie”, die speziell auf die biologische Eigenarten der Krebszellen gerichtet ist (im Unterschied zu Chemo- oder Strahlentherapie).
Orts-spezifische Rekombination
-> Wo tritt diese art der Rekombination wichtig auf?
Site-specific recombination is a type of genetic recombination in which DNA strand exchange takes place between segments possessing at least a certain degree of sequence homology.[1][2][3] Site-specific recombinases (SSRs) perform rearrangements of DNA segments by recognizing and binding to short DNA sequences (sites), at which they cleave the DNA backbone, exchange the two DNA helices involved and rejoin the DNA strands.
Beispiel: V(D)J Rekombination -> Antikörperdiversität
Antikörper
welche Zellen bilden Antikörper?
Aufbau
Antikörperdiversität
• Antikörper (= Immunoglobuline, Ig) sind ein zentraler Bestandteil des Immunsystems
• Ig werden exklusiv in den B-Zellen (= B-Lymphozyten) produziert
• B-Zellen gehören zur Klasse der weissen Blutzellen (Leukozyten)
• B-Zellen werden im Knochenmark (Bone marrow) gebildet
Struktur der Antikörper:
2 identische schwere (Heavy) Ketten: H
2 identische leichte (Light) Ketten: L verknüpft durch kovalente Disulfidbrücken
Antikörper Repertoire von B-Zellen: ca. 10^9 bis 10^12 verschiedene Antikörper !!!
Antigene
Antigene = körperfremde Moleküle (meist Proteine bzw. Peptide), bakterieller, viraler oder parasitärer Herkunft.
unlimitierte Vielfalt von Antigenen !
V(D)J-Rekombination
Ketten / Prinzip der Zufallsauswahl der Segmente
Die V(D)J-Rekombination (auch als somatische Rekombination bezeichnet) ist ein genetischer Umlagerungsprozess an der DNA von Wirbeltieren, der für dieVariabilität der von den B-Zellen gebildeten Antikörper (auch Immunglobuline genannt), der B-Zell-Rezeptoren, sowie der T-Zell-Rezeptoren sorgt.
Während der Entwicklung einer B-Zelle werden die Gene für die leichten und die schweren Ketten der Antikörper und T-Zell-Rezeptoren als zufällige Auswahlen von unterschiedlichen bereitstehenden DNA-Abschnitten zusammengefügt, rekombiniert.
"Die variablen Anteile beider Ketten (V-Regionen) setzen sich aus verschiedenen Abschnitten zusammen. Dies sind die V-Segmente und J-Segmente im Falle der leichten Ketten und zusätzlich zu diesen beiden die D-Segmente im Falle der schweren Ketten"
2 Typen von leichten Ketten: κ (Kappa) und λ (Lambda)
variabler Abschnitt besteht aus V-Gensegmenten und J-Gensegmenten die beliebig kombiniert werden können
1 schwere Ketten (5 Isotypen, je nach konstanter Region): µ (Mu:IgM), δ (Delta:IgD), γ(Gamma:IgG), ε (Epsilon:IgE), α (Alpha:IgA)
variabler Abschnitt besteht aus V-, D- und J-Gensegmenten die beliebig kombiniert werden können
Zusammenlagerung von Kompatiblen RSS
RAG
Kompatible Gensegmente lagern sich über ihre Signalsequenzen (RSS) zusammen
RAG-(= Rekombination-Aktivierendes-Gen) Enzymkomplex:
- RAG1 und RAG2 Proteine werden nur in B- und T- Lymphozyten exprimiert
- erkennt und bindet kompatible RSS Erkennungsstellen der V-, D-, und J- Gensegmente
- Endonuclease Aktivität -> führt zur Bildung von DNA Doppelstrangbrüchen (DSB)
SCID
SCID (engl. severe combined immunodeficiency; schwerer kombinierter Immundefekt):
• Sammelbezeichnung für Krankheiten oder ein Syndrom, die als Gemeinsamkeit eine angeborene schwere Störung des Immunsystems aufweisen.
• Häufigkeit: 1:50'000 – 1:100'000 (viele verschiedene Ursachen) • Immundefiziente SCID-Patienten mit Mutationen in RAG und NHEJ (Artemis, DNA Ligase IV, XLF)
• Patienten mit einem NHEJ Defekt sind zusätzlich auch noch sensitiv gegenüber ionisierender Strahlung = Radio-Sensitive (RS-SCID), da NHEJ in allen Körperzellen eine wichtige Rolle spielt bei der Reparatur von DSB.
• Verlauf ist meist tödlich bereits im Säuglingsalter, da die Patienten praktisch ungeschützt sind gegen Infektionen (bubble babies, Isolierung in sterilen Plastikzelten)
• Einzige Chance auf dauerhafte Heilung: Blutstammzellen-Transplantation. Voraussetzung für Transplantationen ist aber eine Ganzkörperbestrahlung zur Zerstörung des Immunsystems, was seinerseits Krebs verursachen kann.
Transposons
Retrotransposons
Ein Transposon (umgangssprachlich springendes Gen) ist ein DNA-Abschnitt bestimmter Länge im Genom, der seine Position im Genom verändern kann (Transposition).
-> Transposition = Verschiebung genetischer Elemente innerhalb des Genoms
-> In Bakterien kommen nur DNA-Transposons vor
Mit dem Begriff Retrotransposon wird eine Klasse der transponierbaren DNA-Sequenzen bezeichnet. Diese trägt ihren Namen aufgrund der strukturellen Ähnlichkeit mit Retroviren. Retrotransposons verwenden RNA als mobile Zwischenstufe.
-> mobile Elemente ('springende Gene') machen 45% des menschlichen Genoms aus
-> Transposons können Mutationen auslösen
Vermehrung von DNA-Transposons
Prinzip