Transkription
DNA --> RNA
DNA --> RNA
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Cartes-fiches
Eukaryoten RNA Polymerase III?
- tRNA aus etwa 75 ribonucleotiden
- 5S rRNA --> Ribosom-UE
- snRNA U6 --> RNA Splicing UE
- 7S RNA --> Signalerkennung für Eintritt ins ER von gewissen Peptiden
Prokaryoten RNA-Pol β'-UE?
bindet DNA-Matrizenstrang
Wer bildet Heterodimere Nuclear receptors und an was binden sie?
Die Vitamin D3, Thyroxin, Retinolsäurerezeptoren bilden heterodimere mit RXR (Retinoid-X-Rezeptor) und binden an direct repeats die sich nur in der Anzahl dazwischen geschalteter Nukleotide unterscheiden.
Transkriptions initiation in Prokaryoten?
RNA Polymerase & σ-Faktor bindem am Promoter
Elongation in Pro und in Eu?
Pro:
σ-UE bleibt am Promoter und Coreenzym (aBB') wird freigesetzt.
Eu:
TBP/TFIID bleibt am Promotor und Pol II wird freigesetzt duch phosphorylierung am C-Terminus.
Allgemein:
RNA Synthese erfolgt 5'-3' und läuft 3'-5' auf dem Matrizenstrang
Termination in Pro? (3 Facts)
- RNA formt Haarnadelschleife am 3’-Ende
- Ende der Sequenz hat viele A's was zu vielen U's in RNA führt. A-U schwächste Paarung --> RNA-Pol dissoziiert
- Manche Transkripte werden von Rho-Protein (+ATP) terminiert
Transkriptions initiation in Eukaryoten? (5 Steps)
- TBP & TFIID bindet an TATA-Box im Eukaryotischen Promoter
- Weitere TF's (TFIIA, TFIIB, TFIID) kommen und binden
- --> Rekrutierung RNA-Polymerase II (TFIIC) --> Präinitiationskomplex (PIC)
- Schleifenbildung bringt an enhancergebundene Aktivatorproteine (Act) mit PIC in verbindung
- Einige TF's werden durch Liganden Bindung aktiviert --> Hormone.
Ursprung bei Eu und wer bindet was? (3 Facts)
- Zahlreiche TF
- CAAT-Box (-50 bis -150, bindet CBP)
- GC-Region (-50 bis -150, bindet Sp-1)
- TATA-Box (-30, bindet TBP/TFIID)
Wer bildet Homodimere Nuclear receptors und an was binden sie?
Glucocorticoid und Estrogenrezeptor binden an Inverted Repeats
Prokaryoten RNA-Pol σ-UE? (3 Funktionen)
- Erkennt und bindet -35 Konsensussequenz
- Initiiert dann Synthese
- Leitet das 'öffnen' der DNA ein
Eukaryoten RNA Polymerase II?
- mRNA --> messenger RNA
- snRNA (Small nuclear) --> RNA splicing
- miRNA --> post transkriptionelle Genkontrolle
Prokaryoten RNA-Pol β-UE?
katalysiert Phosphodiesterbindung
Helikase die DNA öffner in Pro und Eu?
Pro:
σ-Faktor
Eu:
TFIIH bestehend aus (XPB und XPD)
Prokaryoten RNA-Pol ω-UE?
stabilisiert den Komplex (nicht essentielle UE)
Post-transkriptionelle Prozessierung der mRNA in Eukaryoten? (3 Facts)
- Anfügen von Cap am 5'-Ende (7-Methylguanylate) -->5'--5' Bindung zum ersten Nucleotid
- Spleissen von Introns
- Polyadenylierung am 3'-Ende, nachdem Enzym hinter AAUAA abgeschnitten hat. (100-250 Adenosin-Reste)
Eukaryoten RNA Polymerase I?
rRNA
Ribosomkomponenten (28S, 18S, 5.8S)
Ursprung bei Pro?
- -10 Konsensus-Sequenz TATAAT (Pribnowbox, gebunden von RNA-Pol)
- -35 Konsensus-Sequenz (gebunden von σ-Faktoren)
Prokaryoten RNA-Pol α-UE?
Bindet regulatorische Sequenz
RNA Polymerase Coreenzym besteht aus welchen und wievielen UE?
Was kommt fürs Holoenzym noch dazu?
5 UE's Coreenzym (ohne Sigma): α2ββ'ω (ca. 400 kDa), aktiv, aber unspezifisch
6UE's Holoenzym mit Sigma: α2ββ'σω (ca. 480 kDa)
Splicing Mechanismus? (5 Steps)
- U1 lagert sich an 5' Seite des Introns und U2 an die Verzweigungsstelle
- U4,U5 und U6 kommen dazu
- Bei der ersten Transesterifizierung
bildet sich ein 2’-5’ verknüpftes
Intermediat zwischen dem G am 5’ des
Introns und dem A der Verzweigungsstelle - U1 und U4 dissoziieren ab
- Die beiden Exons werden bei
der zweiten Transesterifizierung
über eine normale
5’-3’ Verknüpfung verbunden
Ribosomen rRNA's in Pro und Eu?
inkl. kleine & grosse UE + Gewicht + Total Gewicht in S + Anzahl Proteine pro UE
Pro:
Grosse 50S UE:
- 5S
- 23S
- 31 Proteine
Kleine 30S UE: 16S & 21 Proteine
Total 30S + 50S = 70S
Eu:
Grosse 60S UE:
- 5S
- 5.8S
- 28S
- 50 Proteine
Kleine 40S UE: 18S & 33 Proteine
Total: 40S + 60S = 80S
