Mikrobio 11. Interaktionen
Syntrophie, Mutualismus, Konkurrenz, Antagonismus
Syntrophie, Mutualismus, Konkurrenz, Antagonismus
- Syntrophie
- Mutualismus
- Konkurrenz
- Antagonismus
- Gemeinsames nutzen einer Nahrungquelle (was alleine nicht möglich wäre)
- Interaktion führt zum Nutzen beider
- Nutzung derselben knappen/begrenzenden Ressource
- Interaktion um das Wachstum des Antagonisten zu hemmen
Problem Blähschlamm in ARA lösen
Problem: Blüte von Filamentösen Bakterien
- Indentivizieren des Bakteriums (FISH)
- Herausfinden was es frisst (Radioaktive Isotope)
- Nahrungskonkurrent finden
Problem Methanemission in Paddyfields
Problem: Überflutete Reisfelder sind grosse Quellen für Treibhausgas
- Beteiligte Mikroben finden
- Stoffwechselwege kennen (insgesammt exergon, von Energie profitieren beide)
- Ansprüche an Umwelt (anoxisch, sehr nahe Symbiose)
- Angepasste Bewirtschaftung (Dünger, Bewässerung)
Problem Käsehaltbarkeit
- Interaktion zweier mutualistischer Bakterien
- Produzieren gegenseitig Metaboliten welche sie nicht mehr selbstständig produzieren können
- Auxotroph (brauchen Vit) ≠ Prototroph
- Interaktion gegen patogene Bakterien
- Ausscheidung von Bacteriocinen (Peptide welche mehr oder weniger spezifisch gegen gewisse Arten gerichtet ist)
Problem Trinkwassersauberkeit
- bis 200'000 Zellen pro ml normal
- die wenigsten können auf Agarplatten wachsen
- erkennbar dank Flow cytometrey
- dank vielen kleinen Bakterien alle ökologischen Nieschen besetzt
- Kein Platz mehr für gefährliche Pathogene
Metagenomik
Lebensgemeinschaften untersuchen
Sequenzieren aller DNA eines Lebensraums (Ozean, Mine, Darm, ARA, Boden)
- Welche Gene sind vorhanden
- Welche möglichen Stoffwechselwege kommen in Frage
- Auf wieviele Mikroben sind die Gene verteilt
=> Symbiosen aufdeken
Problem Fettleibigkeit
- Andere Mikrobenzusammensetzung im Darm
- Fettleibige Mäuse: mehr Methanogene Archaeen
=> Mehr Syntrophien, Grössere Energieausbeute, Bessere verwertung der Nahrung
Woher kommt Darmflora
- Mutter zu Kind
- Geburt
- Stillen
- Nahrungsgewohnheit
- Menschliche Gene
- Vergleich von Eineiigen/Zweieiigen Zwilingen
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Cartes-fiches
- Syntrophie
- Mutualismus
- Konkurrenz
- Antagonismus
- Gemeinsames nutzen einer Nahrungquelle (was alleine nicht möglich wäre)
- Interaktion führt zum Nutzen beider
- Nutzung derselben knappen/begrenzenden Ressource
- Interaktion um das Wachstum des Antagonisten zu hemmen
Problem Blähschlamm in ARA lösen
Problem: Blüte von Filamentösen Bakterien
- Indentivizieren des Bakteriums (FISH)
- Herausfinden was es frisst (Radioaktive Isotope)
- Nahrungskonkurrent finden
Problem Methanemission in Paddyfields
Problem: Überflutete Reisfelder sind grosse Quellen für Treibhausgas
- Beteiligte Mikroben finden
- Stoffwechselwege kennen (insgesammt exergon, von Energie profitieren beide)
- Ansprüche an Umwelt (anoxisch, sehr nahe Symbiose)
- Angepasste Bewirtschaftung (Dünger, Bewässerung)
Problem Käsehaltbarkeit
- Interaktion zweier mutualistischer Bakterien
- Produzieren gegenseitig Metaboliten welche sie nicht mehr selbstständig produzieren können
- Auxotroph (brauchen Vit) ≠ Prototroph
- Interaktion gegen patogene Bakterien
- Ausscheidung von Bacteriocinen (Peptide welche mehr oder weniger spezifisch gegen gewisse Arten gerichtet ist)
Problem Trinkwassersauberkeit
- bis 200'000 Zellen pro ml normal
- die wenigsten können auf Agarplatten wachsen
- erkennbar dank Flow cytometrey
- dank vielen kleinen Bakterien alle ökologischen Nieschen besetzt
- Kein Platz mehr für gefährliche Pathogene
Metagenomik
Lebensgemeinschaften untersuchen
Sequenzieren aller DNA eines Lebensraums (Ozean, Mine, Darm, ARA, Boden)
- Welche Gene sind vorhanden
- Welche möglichen Stoffwechselwege kommen in Frage
- Auf wieviele Mikroben sind die Gene verteilt
=> Symbiosen aufdeken
Problem Fettleibigkeit
- Andere Mikrobenzusammensetzung im Darm
- Fettleibige Mäuse: mehr Methanogene Archaeen
=> Mehr Syntrophien, Grössere Energieausbeute, Bessere verwertung der Nahrung
Woher kommt Darmflora
- Mutter zu Kind
- Geburt
- Stillen
- Nahrungsgewohnheit
- Menschliche Gene
- Vergleich von Eineiigen/Zweieiigen Zwilingen
