Microbio, bactéries

Intracellulaire facultatif, bacille, gram-, oxydase-, aérobie

Clinique : transmission par les poux de corps

- Fievre des tranchées : bactériémie chronique, endocardite. 

- Chez les immunodéprimés -> angiomatose bacillaire et péliose hépatique.

intracellulaire facultatif, bacille, gram-, oxydase-, aérobie

Culture : gélose au sang après incubation prolongée.

Clinique :

- maladie des griffes de chat : adénopathie (2 à 6 mois) , fièvre, myalgies, asthénie, résolution spontanée. Peut compliquer de suppurations., d'une atteinte disséminée hépatosplénique, neurologique, arthrite, ostéomyélite, endocardite. 

- endocardites a hémoculture négative

- immunosupprimé : angiomatose bacillaire, péliose hépatique

- en cas d'inoculation conjonctivale -> syndrome oculo-glandulaire de Parinaud = conjonctivite + rétinite

Dg : PCR, sérologie (sauf chez immunosupp). confirmation par histologie. 

ttt : griffe de chat pas de ttt, adénopathies sévères incision + azithromycine, retinite ou neuro -> doxycycline + rifampicine, endocardite -> doxycycline + aminoglycoside, angiomatose bacillaire -> doxycycline ou eythromycine.

Bacille, gram -, entérobactérie, anaérobe facultatif, catalase +, glucose +, lactose +, oxydase - 

Colonisant du gros intestin.

Culture : au sang, Mc Conkey

FV . adhésines, endotoxine (LPS), Stx (toxine de Shiga), ST, LT, hémolysine A

Clinique : transmission endogène ou exogène (sol, eau, végétation).

- infection urinaire : Fv -> adhésine, en général par voie ascendante, parfois par voie hématogène

- GI : 

-> ETEC : Fv : LT, ST : ressemble a choléra. Intestin grêle. Diarrhée du voyageur par consomation d'eau ou d'aliments contaminés. dure 3-4j 

-> EHEC/STEC : Côlon. Colite hémorragique, diarrhée acqueuse. Si toxine shiga :  sanglante + Syndrome Urémique Hémolytique -> rare. Transmission par hamburger, lait non pasteurisé et jus de fruit. Pour Shiga -> germes de Soja.

-> autres peu importantes. 

- Bactériémie : cause la plus fréquente de bactériémie. Peut etre primaire ou secondaire à infct urinaire, abdo, pneumonie. Frisson, fievre, hyperventilation, altération de l'état de conscience, hypotension, oligurie (anurie), lésion cutanée. Mortalité peut monter jusqu'a 50%

- Méningite néo-natale : antigène capsulaire K1

Bacille, Gram - , entérobactérie, anaérobe facultatif, intra-cellulaire, mobile, catalase +, oxydase- ,glucose +, lactose - , 

Culture : gélose au sang, Mc Conkey 

FV: adhésines, système de sécretion de type 3, endotoxine (LPS), entérotoxine (similaire a toxine du choléra), cytotoxine. 

Clinique : Transmission par animaux ou aliments contaminés ou par voie féco-orale. Inoculum très élevé. Pic d'infection été, automne (pic-nique)

- Entérite : forme la plus commune des salmonelloses. Fièvre, nausées, vomissements, diarrhée non sanglantes et non mucoides, DA, myalgies, céphalées. 2-10j et résolution spontannée. 

- Fievre Typhoide : S. Typhi ou S. paratyphi. Réservoir humaine => voie féco-orale. Manifestation clinique sévère avec bactériémie, fièvre, malaise, et au début peu de symptomes GI (apparaissent au 7-10e jour), bradycardie, éruption érythématomaculaire, hépatosplénomégalie. 

- Bactériémie : S typhi, S paratyphi, S choleraesuis, S dublin. Enfant, personnes agée, SIDA. complications en arthrites, osteomyelites, endo-vasculite, très rarement endocardite. 

Bacille, Gram-, anaérobe fac, ne possède pas de capsule, immobile, entérobactérie, catalase +, oxydase-, glucose +, lactose-

Culture : gélose au sang, Mc Conkey

FV : endotoxine (LPS), toxine de Shiga, système de secretion de type 3, résistance à la phagocytose.

Clinique : transmission féco-orale. Bas inoculum.

- Gasto-entérite : enfant 1-10 ans, adulte en contact avec enfant, homosexuel. Crampes abdo, fièvre, diarrhées. évolution spontanée mais ATB quand meme recommandé.

- Bactériémie : rare

Bacille, Gram-, immobile,, microaérophile, entérobactérie, catalase +, oxydase -, glucose +, lactose-

Culture : gélose au sang, Mc Conkey

FV : endotoxine (LPS)

Clinique : zoonose (rat, viande infectée)

- Peste : 

-> bubonique : morsure de puce, adénopathies axillaire, inguinales ou cervicale, fièvre, bactériémie. Mortalité 75%

-> pneumonique : voie hématogène ou par inhalation, hautement infectieux. Fièvre, malaise, symptomes pulmonaire. Mortalité 90%

- Gastro entérite : Y. entérocolitica. Fièvre, DA, diarrhére, atteinte iliéo-trminal.

- Infct localisée : arthrite, abcès intra-abdo, hépatite, ostéomyélite, atteinte cutanée, méningite.  

Bacille, Gram -, microaerophile, spiralé, mobile, glucose -, oxydase +, catalase +

Clinique : zoonose. Eau, lait, aliments contaminés ou féco-oral. 

- Gastro-entérite : C. jejuni, C. coli, C. fetus, C. upsaliensis. Malaise, nausées, vomissements, DA, diarrhées acqueuses sanglantes. Peut se compliquer en synd. Guillain-Barré, arthrites réactives. Dure de qq jours a une semaine. ttt : résolution spontanée ou macrolides ou fluoroquinolones.

- Bactériémies : C. fetus. Surtout chez immunodéficient,  Bactériémie secondaire a la gastro-entérite avec foyers de méningites, d'infct endovasculaire ou abcès d'os et de tissus mous. 

Bacille, Gram -, anaérobe fac., courbé, mobile, oxydase +

Culture : antigène somatique O utilisé pour le sérotypage. 

FV : endotoxine, capsule polysaccharidique acide, toxine du choléra

Clinique : 

- Choléra : V. cholerae. Eau, aliments contaminés. Début brutal de diarrhées acqueuses (eau de riz), vomissements puis évolution vers déshydratation +++ et état de choc. ttt : réhydratation, doxycycline, vaccin, mesure sanitaire de prévention. 

- Gastro-entérite : V. parahaemolyticus. Fruits de mer, eau de mer contaminée. Peu sévère.

- Infct de plaie : V. parahaemolyticus, V vulnificus. Fruits de mer, eau de mer contaminée.

- Bactériémie : V. vulnificu. huitres. Infct sévère. 

Bacille, Gram -, aérobe, mobile, non sporulé, non fermentatif, oxydase +,  opportuniste, tolère les grandes différences de température et est résistant à de nombreux ATB

Culture : parfois mucoïde, parfois pigmenté, poussent partout

FV : adhésines, capsule, endotoxine, système de sécrétion de type 3, exotoxine A, elastase, cytotoxine, phospholipase C.

Clinique : 

- Infct respiratoire : P. aeruginosa. Slmt si altération des défenses de l'hôte. Trachéo-bronchite, broncho-pneumonie, pneumonie. Fièvre, dyspnée, toux productive, cynose, altération de l'état de conscience, toxicité systémique. 

- Mucoviscidose : P. mucoïdes. manifestation viarable avec toux persistante, diminution del 'appétit, perte de poids. TTT : physiothérapie, combinaison de deux ATB, Tx

- Infct cutanée : chez immunocompromis (brulés). Infct de plaies chir, brûlures, ecthyma grangrenosum, folliculite, paronychie. 

- Bactériémie : immunocompromis. Infct nosocomiales. 

- Endocardite : peu fréquent. !! embole septique !! TTT : ATB + chir. 

- Otite :

-> externe des nageurs = benigne 

-> externe maligne : diabétiques agés, enfants, invasive et agressive. 

- Keratite, endophtalmite : facteurs prédisposants. TTT : topique (kératite), systémique et/ou topique, virectomie (endophtalmite)

- Autres : os, articulation, muscles, urinaire, SNC, GI TTT : en fonction des résistances.

Bacille, Gram -, non fermentatif, opportuniste

Clinique : B. cepacia, B. pseudomallei. Infections nosocomiales. 

- Infection respiratoire : mucoviscidose et maladie granulomateuse chronique

- bactériémie

- Infection urinaire

- Mélioïdose : B. pseudomallei. Diverses manifestations cliniques : asymptomatique; infection cutanée aigue suppurée avec possible bactériémie; bronchite, pneumonie; bactériémie; forme chronique sous forme d'abcès. TTT : Beta-lactame ou sulfamethoxazole-triméthoprime (!! resistance !!)

Bacille, Gram -, non fermentatif, opportuniste 

Clinique : infections nosocomiales. 

- pneumonie

- bactériémie

- infection de plaie

- infection urinaire

- épidémie hospitalière

TTT : résistance a de multiple ATB. sensible à sulfaméthoxazole-triméthoprime, ceftazidime, chloramphénicol

Bacille, Gram-, non fermentatif, opportuniste 

Clinique : infection nosocomiale

- pneumonie

-  bactériémie

- infection de plaies

-infection urinaires

- épidémie hospitalière

TTT : combinaison d'ATB

Bacille, Gram-, non fermentatif

Clinique : infections respiratoies et ORL 

- bronchite

- bronchopneumonie

- sinusite

- otite

TTT : beta-lactames + inhibiteurs de la beta-lactamase, céphalosporine, macrolides

Coque, Gram-, aérobe, fastidieux, diplocoque "grains de café", encapsulé, immobile, oxydase +, catalase+

Culture : colonie mucoïdes

FV : Capsule, lipo-oligosaccharide (endotoxine)

Clinique : transmission par gouttelettes entre contacts proches. portage uniquement pas l'homme. Infection par les voies respiratoires. 

- Méningite : début brutal de céphalées, signes méningés, fièvre élevée.

- Méningococcémie : très grave, peut toucher tous les organes. Thrombi dans les vx. Lésions pétéchiales au niveau cutané. Septisémie

Dg : hémocultures, examen direct ou culture du LCR, détéction de l'Ag capsulaire, PCR.

TTT : Pénicilline. Prophylaxie : Rifampicine ou cprofloxacine. Vaccin polysaccharidique. 

Coque, Gram-, aérobe, intracellulaire, fastidieux, immobile, encapsulé, oxydase +, catalase+

FV : Pili, Protéine Por, Protéine Opa, Lipooligosaccharide, Protéine Rmp, Protéase IgA, Capsule. 

Clinique : Pathogénèse restreint a l'homme. Transmission par contact sexuel. 

- Infection génitale 

-> homme : urétrite avec sécrétion purulente et dysurie, les complications locales et la bactériémie sont rares.

-> femme : cervicite avec secretion vaginale, dysurine et DA. La bactériémie est plus fréquente que chez l'homme. Atteinte de la peau et des articulations. 

-> Nouveau-né : conjonctivite purulente 

Dg : Examen direct très sensible chez l'homme, moins chez la femme. Culture sur gélose au chocolat et sur milieu séléctif. PCR combinée a C. trachomatis. 

TTT : céphalosporines 3eme génération, fluoroquinolone. 

Coque, Gram +, aérobe, catalase + (comme S. doré)

colonisant de la peau 

Coque, Gram +, aérobe, catalase + (comme S. doré)

colonisant de la peau 

Coque, Grame +, aérobe, catalase + (comme S. doré)

colonisant de la peau

Coque, Gram +, aérobe, catalase + (comme S. doré)

résponsable d'otite moyenne chronique chez l'enfant

Coque, Gram +, catalase +, coagulase -

Clinique :

- Commensal cutané

-virulence moindre par rapport a S. doré. (moins de FV : prot A - , superantigène -, etc)

- infct sur corps étrangers -> bactériémie sur cath ou endocardites sur valves prothétiques.

- infct de plaies chir. 

Coque, Gram +, catalase +, coagulase -

Virulence :

-moins que S. doré (Prot A -, coagulase-) 

- plus que les autres staphylo coagulase - ( S doré > S. lugudensis > S. epidermidis)

Clinique : endocardites, arthrites, bactériémie, infct urinaire

Coque, Gram +, catalase +, coagulase -

Clinique : infct os, articulation, endocardites, infct urinaire, infct de plaie, bactériémie

Coque, Gram +, catalase +, coagulase -

Deuxième germe le plus fréquent dans cystite chez la femme 

Coque, Gram +, en chainette, anaérobe fac, catalase -, Groupe A 

Culture : Gélose au sang, beta-hémolyse

FV : prot M, fibronectin binding prot, acide techoique, capsule, prot F1, hyaluronidase, streptokinase, protéases, DNases, streptolysine O, streptolysine S, superantigène 

-> strepto le plus virulent

Clinique :

- infct suppuratives : principale cause bactérienne d'angine, impétigo, dermohypodermite

- infct toxigènes : scarlatine, Streptotoccal Toxic Shock Syndrom 

- du a antistreptolysine O (ASLO) : rhumatisme articulaire aigu, glomérulonephrite aigue

Coque, Gram +, anaérobe fac, chainette, catalase -, Groupe B

Culture : Gélose au sang, 

Clinique :

- pneumonie néonatale, méningite néonatale, sepsis néonatale => dépistage vaginal femme enceinte 

- infct osseuse, ostéoarticulaire, bactériémie, pneumonie, dermohypodermite

Coque, Gram +, anaerobe fac, catalase - , diplocoque, groupe "mitis"

Culture : gélose au sang, alpha hémolyse 

Clinique : streptocoque de la bouche, pneumonies

Coque, Gram +, anaérobe fac, catalase -, en chainette, Groupe C

Coque, gram +, anaerobe fac, catalase -, en chainette, Groupe C (comme S. equi)

Coque, Gram +, anaérobe fac, catalase - , en chainette, groupe "mitis"

Culture : gélose au sang, alpha hemolyse 

Clinique : stepto de la bouche