Biologie moléculaire des plantes

2Nach SDS-PAge, 3Nachdem weiss wie sie sind, BLot SDS> mit AB(antibody) bestreuen, zweites AB gekoppelt an Enzym bindet an 1.AB. Macht farb.produkt

4 Ziel ist die Detektion von Proteinen in Zelle

1. 2-3.Isoltaion von spez. Protein X aus Proteinkomplex durch Ab spez gegen Prot, AB gebunden an Kügelchen, was Prot nach unten ziehen soll via centrifugation.-> Direkt/Indirekt (d:Ab+K=Prot unten; I:Ab+K+Hilfsprotein(insolublep.ex.)=Prot unten von ganzem -> Analyse von Intersse Prot.

4: Analyse von Protein-Portein Interaktionen= Precipitaion von Prot X, welches mit Prot Y interagiert für welches der AB aufgezüchtet wurde!

1. Wird gebraucht zum aussortieren von DNA/RNA Stände nach grösse

2. Elekt. Feld erzeugt (elektroden) Dna Moleküle (neg geladen) wandern durch Gel. Kleine Moleküle wandern schneller als grössere Je nachdem welche Grösse von Molekülen gesucht-> Agarose Gehalt Lösung reguliert (Klein=viel Agarose). Marker dazu addiert, damit man D(R)NA sieht.(p.ex. EthidiumBromid, oder Coomassie Blue) Abgleich mit Marker zum sehen was wieviel

1. SüD= Dna, Ziel ist, eine spez. DNA Sequenz im Genom zu suchen und untersuchen wieviel es davon hat. oder In einem Gemisch eine spez. Dna nachverfolgen können.

2. 0Verdauung durch REstriktionsenzym, Abgleich der Länge der Stücke durch Agarose Gel elek..  1Dna wird denaturiert (NAOH) und auf Nylonmemb geblottet. 2Radioaktiv markierte Sonde (oder chem. modifizierte Nucleotid, die Immunodetection ermöglicht) wird hinzugefügt mit Ziel dass sie sich mit Dna strand hybridisiert.  3Es kannfestgestellt werden, wo sich Sequenz komplementär befindet.

1 RNA; Analyse von RNA Transkripte
2RNA isoliert  und in AGarose G.E. nach Grösse aussortiert. Blot auf Nylonmembr. Hybridiserung surch molek. markierte Sonde (radioaktiv, chem.) Komplementarität ermöglicht Bindung. BESAGT, WIE VIEL RNA SICH IN ZELLE BEFINDET!

HITZEABHängig.Vervielfältigung der DNA

1. Denaturierung durch Hitze, Primerhybridisierung (Primer kann dank abkühlen ansetzen) Primer beginnt Elongation( druch anziehen von der DNA Polymersae)

1 RFLP (restriktiomsfragment Längenpolymorphismus), STR (short tandem repeats=2BP die sich vermehrt folgen ) SNP (single nucleotid polymorphism) 

2. durch PCR oder Southern Blot ; durch PCR, Gelelektrophorese oder Sequenzierung ; Sequenzierung oder Oligonucleotidhybridisierung

RFPL= Vorraussetzung, Eltern unterscheiden sich nach Beschneidung durch Restrinktionsenzym ( 4 vs 5 Stücke), diese Besonderheit ermöglicht es das spez DNA stück in den Nachkommen zu verfolgen. =Das Fragmentmuster ist diagnostisch für einen Elternteil

On constate que le % d'amidon et d'amylose n'est pas le même selon pois RR ou rr! (rr<RR|amidon, RR<rr|amylose)->Hypothèse, que RR/rr qq chose a voir ac ça. Comme rr a un defaut amylopectine (1/2constituant de amidon) on déduit que defaut enzyme SBE.

Soit problème de régulation des gènes ou problème de fonction de l'enzyme s'occupant.

Confirmatiion par: L'allèle rr amène-t-il tjr SBE deficient? les 2 caractér. sont 1''% liées? Pour a répondre, analyse de l'hérédité de mutant SBE et Wt SBE en correspondance ac RR/rr.

2Clonage diff. cDNA (de biblio) ds vect bactér.->Port fabriqués, Lyse bacté, -> Blot -> incubation ac marquer Anticorps.

On connait desormais les cDNA qui code pour Prot. On analyse Sequnece, On va élaboré une carte de restricition ( lieu coupure du a enzyme), On va analyse le nombre de transcrit SBE dans RR/rr.

Resultat: gràce a Nothern Blot, on voit que bcp moins mRNA SBE chez rr, la SBE-RNA est plus grande chez rr que RR.(0.8kb)

On veut ensuite voire si la sequence ADN corresp. est aussi plus longue: Pour cela Southern Blot, on voit que chez RR ou rr l'ADN est de taille diff. = Conclusion, le bout dans rr et pas dans RR interfère avec production de SBE

Schlussendlich, um sicher zu sein, dasRR/rr Allel mit SBE/sbe übereinstimmt= LINKAGE ANALYSIS(Kreuzung RR mit rr -> dank RFLP kann man Sequenz verfolgen in Nachkommen. Da r=rezessiv, müsste rr Pflanze sbe/sbe sein (homozygot) falls das nicht der Fall wäre = Rekombination über die Alllele

Man findet keine, nur rr hat sbe....(keine Rekombination)

3.sequancage d'ADN, on voit que avant er après sequence inseré il y a sequence inverted repeat et direct repeat ce qui est typique pour des TRANSPOSONS!

Sont des genes sautants!(elements genetiques mobile)

Maïs: SI transposon, gène synthèse pigments inactifs ; si tranposon out = synthèse. = Si synthèse anthrocyan reprimée= jaune ac transposon, si transposon out, yhnthèse active -> grain bleu) SI pendant croissance le transposon sort = possibilité d'un grain bigarré (jaune-bleu)

1. Les AC(éléments autonome) sont les activateurs ils sont entouré de sequence inversée repetée 11 bases (IR), ils permettent aux DS(éléments non-autonome) de sauté et de ev. s'intégrer dans un Gène qui ne pourra ev.plus être exprimé (grain jaune=reprimation anthocyane)

2 Transposition d'ADN en fragments(>5kb) ; Ont séquence terminale inversée repetée (TERMINALE INVERTED REPEATS,IR)  ; Frequence de transpo est régulée selon devlpmt ; codent pr produits de gènes qui sont importants pour transposition!

Inverted repeats: entoure les AC, 11 bases, code pour point d'attache de l'enzyme essentiel pour transposition: TRANSPOSASE, Elements DC sont pareils sauf que pas de transposase donc ne peuvent pas se transposer seul (Nécessité d'un AC)

Les AC trouve des SHORT DIRECT REPEAT sur l'ADN comme cible de fixation! la transposase coupe 2*brin ADN avec un bord plus long que autre. De la les SEQ IR vont se fixer + transposon! ON RECONNAIT GRACE A SEQ IR! possible que c footprint continue a deranger reg d'expres. gènes

1Transposition par RNA, par biais de ReRT (reverse RNA TRanskirpatse), comme par RNA ils peuvent bcp s'amplifier, ont LTR (long terminal repeats) des 2 cotés, la mRNA code pour tte fonctions importantes pr transcription (même RERT

2 contient promoter régule expression gène (s'il n'était pas inclu, le retro ne pourrait plus se repliquer depuis nouvel endroit!!!

Les retrotransposons sont inactifs durant dvlpmt plante, slmt lancé en cas de stress car LTR contien PROMOTER STRESS ACTIF!

3. Par des RECOMBINATION HOMOLOGUE INEGALE: sont seq repétés entre 2 chromosome pdt Méiose qui empêchent l'allignement correct, par après, les seq repétés seront repartis inégalement sur 2 chromosomes ou DANs 1 chromosomme CO entre seq repétés sur 1 brin. -> ADN entre deux va être supprimé

4. Recombinaison inégale , déletion d'un transpospon, déletion de 2 transposon

1. Agrobacterium tumefaciens (t-dna vecteur + TI-plasmid), canon a particule, IN PLAnta, marqueur selectionnable/visibles

2.T-DNA: 1 bordure droit / 1 bordure gauche seq repétées, Monobrin découpé finalement, Gène contenu: OPine (prod. A.aminés de bactérie par plante) + ENzyme pour Phytohormon-biosynthèse(IAA&CKK) ->Accumulation Phytohormone provoque boule cancerigène. (DIFF ac T-DNA normale-> seule A.aminés bacté y sont remplacé DONC on peut supprimé Gènes OPINE bacté et gènes phytohormones pour y ajouter autre chose cf vecteur transfo!))

3La pathogénicité bacté depend de ces gènes, ces Gènes codent pr prot pour: detection signal blessure plante, excision et introduct de t-dna dans cell hôte

 4.Tous T-Dna possèdent un gen marqueur selectionné ce qui confère a la plante une resistance spéciale-> par ce procéssus on arrive a isoler les cell infecté! (p.ex. R a camamycine, R aux herbicides, R aux antibio)

5.on trempe les fleur dans inbibation de bacté. Après recolte graines on les teste a resistance. -> 1% transgen!

-Bombardement gun particul: Tire paaticule ADN étranger (couplé a R a qq chose) sur cell transformable-> impregnation, l'ADN s'installe stablement-> trie sur miliue selectif grace a R

2Genetique plantes transgen: plante transgen hemizygote (slmt 1 chromo R), pour arriver a homozygote-> autofécondation ; mais possible que diff. t-dna inclu dans plante donc transgen homozygt difficile.

3 Colonisation bacté -> Induction gènes virulence -> Formation T-DNA (excission et introd.) ->Transfert T-DNA vers plante ->Transport T-DNA vers nucleus cell hôte -> Intégration T-Dna ds génome plante

4 Plante blessé -> subst. phénol libéré -> active gène vir.A et G! 1) Vir A détecte phénol->AUTOPHOSPHORYLATION de Histidine 2)Transmission Phosphat vers Vir G 3) outils pr excision + export t-DNA préparés + protection & trasnport =  4) Vir D1 reconnait LB & RB -> découpe en monobrin.  Vir D2 se lie a t-DNA pour éviter sa dégradation 5) Vir E s'y attache également pour même raison 6) Vir D1 et Vir T congtiennet seq signalisation nucleus 7) Vir B code pour complèxe poreux pr export t-dna ac Vir D2 et E2 8) L'hôte par ses facteurs doit finalisé l'intégration du t-dna.

Surexpression d'un transgen-> suraccumulation de prot pour voir ou elle sa deplace, cette surexpression influence t elle le phenotype

Repression d'1 gène endogèn-> but est d'inhiber expression d'un gènegrâce a cDna antisense p. ex. par 2*brin RNA

Construits gène-promoter-> ANalyse de reguzlation dune prot en fct de son promoter mis avec reporter gen.

PHYtochrome (rougeRl et rouge foncé FRLinhibition floraison, evite ombre) vs Cryptochrome, Phototropine (bleu, phototropisme, ouverture stromata) = ensemble, germinaison, deétiolement

PHY:proteine photoreversible, mesure rapport RL/FRL, forme active PFR=FRL, partie tetrapyrrol-chromophore capte la lumière, Proteinkinase, active qd RL,  transmet message vers noyau. Proteine constitué de 2 homodimer

PHY A & B plus important: B capte ratio (cmb lumière) dans tissus verts, A dans étioler, lumière ou pas!$

1. Captage->chgmt confo en actif(PFR) APO Protein ouverte -> PFR s'accumule dans le nucleus (suite a transmission histidine Kinase)-> chgmt expression gènes-> PMG  contraire, PFR capté -> APO Prot fermée, PFR pas dans nucleus, pas chgmt gènes-> SMG!

DET, COP, FUS-> PMG dans obscurité  ;phéno svt léthal, les gènes ont donc fonctionbs vitales pas slmt pour PMG, ils codent pour des régulateurs négatifs (INhibiteurs) de la PMG-> si endommagés il y aura de tte facon PMG.

HY-> SMG à lumière; plante ne detecte plus lumière ou partie de chaine transmission signal est cassé

1)il fait partie d'un complexe multiproteine( 8 prot)= COP9-SIgnalosom (CSN), les facteurs COP DET etFUS codent pour d'autres sous unités du MPC-> siune partie MPC muté, le complexe est instable

CSN régule fonction de COP1 et HY5 via proteolyse.-> si CNS présent, COP1 & HY5 dégradé. Quand CSN desactivé par mutation ou lumière-> cop1 ds cytoplasme-> libère HY5 qui agit comme FT des gènes régulé par lumière =PMG

1Yeast two hybrid et 2Immunoprecipitation

On teste ac 1, sur gène Gal4, on a mol GBD qui est couplé a GAD

on va jouer avec cet appairement pour trouver quelle proteine sur GBD interagit le mieux ac prot sur GAD= PHY avec PIF car cela permet le reconstitution du TF du gène Gal4

Mutations de PHY font que PIF se lient moins bien!

1)Par particle bombarding, Gen reporter Gus-PIF3 dans oignon-> après 24 h il y en a partout! surtoutv noyau!!! PIF code pour PAS de PHY

2) Quand PFR dans noyau-> inhibe PIF de 3 manière:

-en phosphorylisant et ubiquination de PIF pour dégradation!

-EN inhibant la liaison de PIF ac DNA

3) Integration de signaux environnement: Lumière , temperature ou signaux endogènes: GB,rhytme circadien 

-Indirectement en inhibant la liaison PIF-DNA par stabilisation de HRF et Della qui interagissent avec PIF et inhibent son activité

Ubiquination-> en se liant commande leur degradation. mais peu aussi modifié prot post-traductionnellenemtt selon tyoe liaison. peu varier stabilité, fonction ou repartition prot. Peu avoir fonctions ds tranmission signaux.

Port très conservé!(très important) -> G76 attache UB sur prot a degradé, Lysin 48 & 63 permet polyubiquination 

L'ubiquination se fait en 3 étapes (E3 final met sur prot) E1 active Ub->Ub trasnferé a E2...

UB aussi pr acide jasmonique, IAA, GB,  en enlevant un facteur inhibant un autre qui déclencherait la transcription dans le nucleux )JAZ, AUX/IAA, 

Det 2 code pr enzyme a focntion catalysation biosynthèse stéroides-> en traitant des det 2 avec BR on a plante normale. ( le plus fort effet qd Det 2 + nuit + Br, que faibel effet qd DEt2 + jour+ BR)

1) Stimule croissonce longueur/hauteur, c'est eux qui sont reponsable de grd taille plante etiolé! Augmente la croissance des parties de la tige. sont actofs en tres petite dose, stimule division cell, inhibe croissance racine, stimule croissance tube pollinique, DIfférenciation tissu conduction, stimule pord d'ethylen

2 après administration, 4h on voit resultat= RAPIDE

3 sont nains ( a lumière, deétiolé a l'ombre), vert foncé, diminue fertilité, floraison & senescence retardée

3.1 Mutant de biosynthèse Br-> cpd a reponse au stress augmenté ac plus de prod de prot, application BR inhibe mutisme

3.2 Mutant insensitif a BR-> application de BR ne vchange rien! Leur problème se situe a la reconnaissance de BR & transmission de signaux succédant

BRI1 code pour recepteurkinase LRR transmembranaire  à domaine Leucine rich repeat (LRR) (typique pour prot qui on fonction transmission signal. LRR est point d'attache a ligand.

LRR= forme de fer a cheval ou ligand se lie, sont aussi présent dans lesgène de detection de pathogène (p.ex flagellin| MAMP ou PAMP) et induiront une reponse immunitaire, mais aussi pour prot devlpmt plante Clavata (meristem grandit bcp) on role de capteur.

1)BRI1 est recepteir de BR et transmet signal via cascade phosphorilysante (donc pas comme animaux (recepteur active recepteur du noyau)

SI BR lié a BrI1 BAK1( aussi LRR) vient aussi et forme un heterodimer qui transphosphorylisera le cytoplasme. Par cette cascade de Proteinkinase, le signal va finir ds noyau pour activer l'expression des genes!

BAK1 s'associe egalement a d'autre LRR recepteurkinase p.ex. flagellin poiur reponse immunitaire

BRI+ reconnait BR via LRR-> transmet siganl via cascade proteinkinase vers noyau

XA21 gène de R qui detecte signal pathogene et lance defense immun.

Si on echangeait recepteurs mais gardait meme reponse, BR declancherait defense immun.

1)Comme il influence  l'espression genetique, les genes exprimés doivent favoriser par leur prot traduites la croissance.

Gène BRu1code pour XET qui catalyse la separation des laisons dansd la paroi et permet la croissance en longueur!

$DONC si BR augm.-> BRU1 augm.->Paroi cell. plus extensible-> croissance en longueur

Chgmt d'1 fct ou expression d'1 gène sans changer sa seq.(loi de mendel ne s'applique pas)

1) essai de surexprimation d'1 gène dans petunia pour qu'elle soit très foncée; création transgen (t-dna) = au lieu de fleur foncée on a reçu plante depourvu de pigments a certain endroits ou modèle blanc sur fond noir

->PTGS(Dégradation mRNA gène ztransgénique et endogène (complet /partiel) en fait les gènes sont transcrits, mais mRNA est dégradél avant d'être traduite VS TGS par methylation de RNA au niveau de zone d'attache du promoter, dsRNAhomologue a promoter -> cuase methylation et inactivation en recrutant enzyme qui remodèle chromatine

3)Injections de RNA antisense cause silencage spec. a sequence(=RNAi) -> introduction dsRNA ds c. elegans se revèle plus efficace pour silencer que l'injection d'une sequence RNA sense ou antisense!!!! 

Tous les genes peuvent etre silencé grace a RNAi (Gene knockdown) -> RNAi est un bon outil génomique fonctionelle

PTGS lié a production de petits RNA de sense/antisense(car possible que dsRNa existe mais soit trop petit pour detection)

1)RNAi=dsRNA dirige le clivage dpdt ATP des mRNAsur nucleotide specifique-> donc les plus petits bout dsRNA sont cliver de grand bout dsRNA par ATP clivage! Cela produit de siRNA(short interfering) qui chercheront seq complémentaire sur mRNA pour les cliver finalement

2) strcuture: 21-23nucleotide long duplex de dsRNA avec un decalage pour accroche(like transpospons) ac phosphat coté 5' et OH côté 3'. Cette structure ressemble a enzyme RNase-III-like qui clive ce qui nous amène a la famille des DICER (aussi RNase-III) en tant que mediateur du clivage de dsRNA

Mecanisme: Dicer= clive dsRNA en petit bouts prédefinis(21-23) donc dsRNA->siRNA ; RISK=  (RNA inducing silencing complex) utilise un brin siRNA comme guide pour cliver mRNA seq complementaire!

3)DICER= plantes ont bcp dicer (DCL=dicer like) pour former differente taille siRNA, 

RISC= MPC, formé par AGO (argonaute)-> attache a démèle dsRNA & associe RNAse qui catalyse et clive la RNA complémentaire |AGO-> une partie PAZ attache RNA et DICer + PIWI= endonuclease)

4) dsRNa coupé par DIcer  en siRNA (duplex 21-23pb), dénaturé -> 2 chemin soit boucle amplification ou siRNA sert de primer pour lancé RdRP (RNA dependent Rna POlymerase) ce qui va reproduire dsRNA qui sera cliver par DICER et rpoduira plus de siRNA finalement...

l'autre chemin: siRNA dénaturé,Complèxe RISC s'y attache, se lie complémentairement a RNA après avoir délier et rendu droite, clivage RNA

MAmifere pas de RDRP donc pas d'amplification, isectes slmt clivage et degrad, 

Ont évolué comme systeme immunitaire du genome(contre DNA etranger), ou contre gènes viraux (utilise dsRNA pr replication), certains virus on des silencing inhibitors qui empechent nos defenses RNAi...

1) ssRNA(1brin) viral fait RDRP pour dsRNA, clivage par DICER-> complexe RISC (AGO) se lie a siRNA resultant silencage replication et exprimation (plantes pvt se guerir d'infection et devenir R, même transmission de R vers new feuille -> dpt de silencage provenant de sirNA?) oui car les petits siRNA correspondant a RNA viral vont se repartir ds tous tissus et garantir la R grâce aux PLASMODESME et PHLOEM...

Mais les viruses on évolué des proteines supressives qui bloque RNai (pvnt bloquer RNAi a tout niveau!

2)ont role important pour regulation (d'expression des gènes) sont processé de RNA épingla e cheveux. LEs miRNA sont abondants dans bcp de plantes

Chez humain: au moins 800 decouverts, derivent d'une classe speciale de gène qui sont differnets de ceux codant pour prot!

Description:Ont forme epingle cheveux, contiennent partie dsRNA -> souirce fonctionnel de miRNA, miRNA se lie a mRNA par complémentarité et derangeant leur traduction ou les clivant

EUCARYOTES ont bcp miRNA ac role regulateur genes important-> nouveau mecanisme de regulation! p.ex. pour vontrol d'expression de genes endogenes!

Structure: Produit par DICER par clivage, coupe partie avec boucle de  RNA transcrit primaire (PRI-miRNA)égal si côté 5' ou 3'!

pri-miRNA stabilisé par DCL et HYL1-> Serrate se lie et change le tout en pré-miRNA-> HEn1 se lie et protège RNA en ajoutant groupememnt methyl chaque 3'-> Hasty transporte en dehors noyau...(miRNA en duplexlors de sortie)

TRES FORTE CONSERVATION DANS miRNA ENTRE LES ESPECES!

POur plantes: DCL provoque augm de miRNA (sans DCL pas de miRNA!), diff ac animaux et que miRNA plantes on complementarite casi parfaite!

Fonctions miRNA: timing croissance, floraison, reponse stress, polarité, identité organe fleur...

1) agents pour RNAi, 21-25 nt preocessé par DICERdepuis dsRNA, degradation RNA avec complementarité parfaite! siRNA s'attachent a sequence depuis lesquelles elles int ete derivés!!!

2)Codé par génomedepuis précurseurs en epingle a cheveux, processé Dicer 21-25nt  en RNA, bloque traduction de mRNA grace a complementarité non-parfaite!, dégrade RNA avec complémentarité parfiate!! BUT miRNA sont différents de  genes parentaux!(forme 1% de gènes codant!)

MAis  miRNA peut fonctionner comme siRNa et son complexe RISC en clivant la mRNA!

MAis DIFFERENT DICER: 1) DCL 2-4, 2) DCL1 aussi AGO: 1) 1/4, 2) 1

3) contrôle fct et expression different genes.  garce a seq complementaire. (trouvé grace a mutant)

4) plantes transformé T-DNA ac enhancer 35S a RB, cela incite a avoir surepression de genes car polycistronique-> evite surexpression ac miRNA!!!

Regule croissance le long des axes donnes, aussi stabilité, communication, modèles architecturaux

Les plantes n'ont pas Tight junction pr communication... compartimentation en domaine apical, basal , outter lateral et inner lateral!

1)Par IAA, p.ex maturation fruit, croissance racinaire, gravitropisme racinaire p.ex. ou surexpression d'IAA d'un coté pour croissance vers bas!

IAA transportés par PIN prot

2)Transcris ds noyau, traduit GOLGI, vésicule relaché vers membrane pour exocytose, grâce a filament actine (cytosquelett) il y arrive. VESICULe contient prot PIN qui indique ou il doit DOCKEr (TARGET SIGNAL), cette PIN restera dans membrane plasmuque apres fusion.

(SI augm. P hydrostatique et osmotique on procedra  a de lexocytose de vesicule pour augmeneter surface de MP.

3)sont detecteurs de polarite, regulés par GEF &GAP -> GTPase dans cytosol ac contact ac membrane est active qd phospo-> GAP lui enlève P (GTP inactif)-> GEF enlève P  de GTP (donne GDP) -> le transmet a nouveau a GTPase pour le rendre actif!

( p. ex. analogie ac bourgeonnement levure grâce a accumulation IAA d'un coté!)

3)ROP pour: formation poil racine, croissance tube pollinaire, formation forme cellulaire, reponse a peu oxygene, Reponse a ABA

Processus: ROP se fixe a endroit a agrandir, microfilaments actine vont vers labas ainsi que Vesicule pr exocytose, croissance de paroi!

INteraction: Rop avec RIC leur fct premiere est la stabilisation du cytoskelett )actinfilament), analyse par yeast to hybrid..

4)Leur morphologie depend de coordination cell-cell, de polarité multidirectionnelle, sont cell non diffenreciés, conmtroler par interaction RIC-ROP

RIC4- ROP2 forme lobe au contraire ROP6-RIC1 inhibe lobe

AUXin-> ABP soit RIC1-ROP6-> stimule MKIcrotubule et inhibe lobe et créer indentation ||| ou RIC4-ROP2-> stimule filament actine et va créer lobe

IAA-> ABP _> aller sur ROP6-RIC1 pour intégrer MT!! Par contre IAA -> ABP-> aller sur Ric4-Rop2 et f-actin va le faire ressortir immediatement par exocytose.

5) couplage IAA/ ABP dans apoplaste (hors cell) et se transmet ds cellule par RLK(receptor like kinase) =TMK qui interagit ac ABP

L'interaction ABP-TMK active ROP dans cellule!

1) PIN 1,2,3,4,7 et ABCB

des prot coating assurent le transport de vesicule vers membrane et docking! p.ex. COP1(golig vers ER), clathrin (ER vers golgi), COP11 (MP vers Gogl))

Le transporet dnas cell se fait grace a myosine couplé sur filament actine, la charge de molécule determine a direction...

REPP est regulateur polarité grace a PIN

ARF-GEF (GMOM) active GTPaseet est inhibé par BFA. Il s'occupe du recycling vers et depuis al MP. -> PIn 1 est depednant de ARF-GEF GNOM

Une inhibition par BFA fait que IAA ne sort pas de cell.

endocytose, direction, est slmt regule apres sortie de ER... clathrin dirige vers coté! 

le targetting apical basale regule des PIN est regulé par phsophorylisation...

NPA bloque transport polaire auxin

La surepression de PID cause shift basal -apical!!!

par transcytose, PID/PP2A regule etat phosphorylation