Biochemie-Metabolismus
Vorlesung Unibas
Vorlesung Unibas
Nenne 3 Enzyme, welche Peptidketten Spalten und an nach welchen A.S. diese Spalten
Chymotrypsin: nach Aromatischen, Trp, Phe, Tyr
Trypsin: nach + geladenen, Lys Arg
Elastase: nach kleinen ungeladenen
Welche A.S absorbieren im UV-Spektrum? Gib diese nach Abnehmender Absortption an
Trp > Tyr >Phe
Was mach die Proteinkinase, und an welchen A.S?
Beispiele von Proteinkinasen?
Überträgt Phosphatgruppe auf OH Gruppe
Bsp.:cAMP, Ca\(^+ \)
Was ist Alosterie?
Nene ein Beispiel
Bindung vom Substrat an eine Untereinheit erhöt die Affinität der anderen Untereinheiten --> Sigmoidaler Substratkonz. - Aktivitäts Kurve
Bsp: Hämoglobin
Nenne zwei Modelle für Alosterie
sequentielles Modell: jede eingegangene bindung einer Untereinheit verändert deren Struktur und erhöht die affinität der weiteren Untereinheiten
Konzentriertes Modell: jede eingegangene Bindung einer Untereinhei erhöt die affinität weiterer Untereinheite. Striktur verändert erst nach dem alle Untereinheiten an ein Substrat gebunden haben
Was sind unterschiede zwischen Myoglobin und Hämoglobin?
Myoglobin:
- Monomer
- nicht Allosterische O\(_2\)Bindung --> gleichförmige Sättugunskurve
- Affinität bereits bei niedrigem Konz. Druck
Hämoglobin:
- Oligomer aus vier Untereinheite
- Alosterische O\(_2\) Bindung --> Sigmoidale Sättigungskurve
- nimmt bei hohem Druck (Lunge) O\(_2\) auf und giebt es bei niedrigem Druck (Muskel) effizient ab
Nenne Enzym und kovalent gebundenen Cofaktor
Nenne Enzy und nicht kovalen gebundener Cofaktor
Kovalen
- Pyruvatdehydrogenase mit Liponsäure
- Pyruvatcarboxylase mit Biotin
nicht Kovalent
- Pyruvatdehydrogenase mit Thiaminpyrophosphat
- Cytochromoxidase mit Haem
Netto Edukte und Produkte der Anaeroben Glykolyse
Glucose+ 2ATP + 2 NAD\(^+\) 2 P\(_i\) \(\rightarrow\) 2 Pyruvat + 2 ATP + 2 NADH \(\underrightarrow{-2 NADH}\)
entweder Lactal + 2 ATP
oder bei Hefe 2 Ethanol + CO\(_2 \) + 2 ATP
Was sind die Stark exergone Reaktionen in der Glycolyse
1. D-Glucose mit Hexokinas zu D-Glucose 6-P (1.Schrit mit ATP gebrauch)
2. D Fructose-6-p mit Phosphofructokinase zu Fructose 1,6 bis Phosphat (3.Schrit mit ATP gebrauch)
3. Phosphoenolphyruvat mit Pyruvatkinase zu Pyruvat (letzter Schrit, produzuert ATP)
Netto Edukte und Produkte der Aeroben Glycolyse
Glucose + 2 ADP + 2 NAD\(^+ \) + 2 P\(_i \) \(\rightarrow\) 2 Pyruvat + 2 ATP + 2 NADH
1 Pyruvat produziert über TCC isgesamt 4 NADH, 1GTP 1 FADH\(_2\) (4*2.5+1+1)= 12.5 ATP äquivalente durch Atmungskette
2 NADH = 3-5 ATP äquivalente durch Atmungskette
Total 30 ATP äquivalente (anaeorob nur 2!)
Transport von Acetyl-Coa und NADH zwischen Mitochondrien und Cytosol
.
Wie wird Malat und Aspartat zwischen Mitochondrien und Cytosol Transportiert?
.
Was ist eine Anaplerotische Reaktion?
Nenne Beispiele (3)
Auffüllreaktion für den TCA-Zyklus. Intermediate welche z.B füt Fettsynthese oder A.S gebraucht werden werden nachgeliefert. Surch produktion von Oxaloacetat oder Malat durch Pyruvat respektive Phosphoenolpyruvat.
Bsp:
- Malatenzym: Pyruvat \(\rightarrow \) Malat
- Purucatcarboxylase: Pyrucvat \(\rightarrow \) Oxaloacetat
- PEP-Carboxylase: PEP \(\rightarrow \) Oxaloacetat
Wie viele ATP-Äquivalente gewinnt man durch den Abbau aus Myrisoyl-CoA (14 C Atome). Aerob und Anaereob.
Aerob:
6 \(\beta\)-Eliminierungen egiebt 6 NADH 6 FADH\(_2\) und 7 Acetyl-CoA \(= 6*(2.5 +1.5)+7*10 \) = 94 ATP äq.
Acetyl-CoA ergiebt im TCA-Zyklus CO\(_2\) + 3 NADH + FADH\(_2\) + GTP = 10 ATP äq.
Anaerob:
0 ATP äq. da NADH und FADH\(_2\) nicht verwendet werden können.
Unerschiede zwischen Fettsärueaufbau und Abbau. (4)
Abbau:
- Ort: Mitochondrien
- Acyl-Carier: CoA
- e\(^- \)-Carier: FAD, NAD\(^+\)
- Bausteine: Acetyl-CoA
Aufbau:
- Ort: Cytosol
- Acyl-Carier: ACP
- e\(^- \)-Carier: NADP\(^+\)
- Bausteine: Malonyl-CoA (ACP)
Wie funktionier die Glycogen Mobilisation
Glycophosphorylase Spaltet \(\alpha\) 1-4 Bindung und setzt Glucose-1-P frei bis in die nähe einer \(\alpha\) 1-6 Bindung (Seitenast). Danach Spalten Debranching Enzyme bis auf die \(\alpha\) 1-6 Bindung . Diese wird durch Hydrolyse Abgespaltet
Wie funktioniert die Glycogensynthese?
1. Glucose wie wie im 1. Schrit der Glycolyse zu Glucose-6-P (Aktivierung).
2. Glucose-6-P + UTP --> Glucose-UDP +PPi
3. + Glcucogen\(_n\) -->Glucogen\(_{n +1}\)+ UDP
Erste Glucose bindet an einTyrosin, danach werden \(\alpha\) 1-4- Bindungen gebildet. Enzymaktivität bewirkt umhängen einer Kette zu einer \(\alpha\) 1-6 Bindung
Was ist der Unterschied zwischen Phosphorylase und Phosphatase
Phosphorylase katalisiert die Phosphorolyse: Beim Abbau von Glucogen ensteht bereits Glucose-P welches one weitere Aktivierung vür die Glucolyse verwenden Kann. (1 ATP wird eingespart)
Phosphatase Kat. Hydrolyse: Glucose wird durch Wasser gespaltet und es enstteht nur Glucose
Was produziert der Pentosephosphat-Weg?
Glucose-6-p wird zu Ribose-5-P (wichtig für DNA/RNA) und 2 NADPH
Ribose5-P kann anschliesen durch Transketoisomerase und Transaldoisomerase wider zu Glucose-6-P
Was macht die Transaldolase/Ketolase?
Wo wird diese Gebraucht?
Transaldolase: Übertragt eine C3 Gruppe einer Ketose auf eine Aldose
Transketolase: Übertragt eine Ketol (C2) Gruppe Auf eine Aldolase
Penthose Phosphat weg und Calvin-Cyklus
Welche A.S kann dimere Bilden?
Cystein
Weche A.S Fluoresziert?
Try
Welche A.S enthalten Schwefel
Cys, Met
-
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-
Lernkarten
Nenne 3 Enzyme, welche Peptidketten Spalten und an nach welchen A.S. diese Spalten
Chymotrypsin: nach Aromatischen, Trp, Phe, Tyr
Trypsin: nach + geladenen, Lys Arg
Elastase: nach kleinen ungeladenen
Welche A.S absorbieren im UV-Spektrum? Gib diese nach Abnehmender Absortption an
Trp > Tyr >Phe
Was mach die Proteinkinase, und an welchen A.S?
Beispiele von Proteinkinasen?
Überträgt Phosphatgruppe auf OH Gruppe
Bsp.:cAMP, Ca\(^+ \)
Was ist Alosterie?
Nene ein Beispiel
Bindung vom Substrat an eine Untereinheit erhöt die Affinität der anderen Untereinheiten --> Sigmoidaler Substratkonz. - Aktivitäts Kurve
Bsp: Hämoglobin
Nenne zwei Modelle für Alosterie
sequentielles Modell: jede eingegangene bindung einer Untereinheit verändert deren Struktur und erhöht die affinität der weiteren Untereinheiten
Konzentriertes Modell: jede eingegangene Bindung einer Untereinhei erhöt die affinität weiterer Untereinheite. Striktur verändert erst nach dem alle Untereinheiten an ein Substrat gebunden haben
Was sind unterschiede zwischen Myoglobin und Hämoglobin?
Myoglobin:
- Monomer
- nicht Allosterische O\(_2\)Bindung --> gleichförmige Sättugunskurve
- Affinität bereits bei niedrigem Konz. Druck
Hämoglobin:
- Oligomer aus vier Untereinheite
- Alosterische O\(_2\) Bindung --> Sigmoidale Sättigungskurve
- nimmt bei hohem Druck (Lunge) O\(_2\) auf und giebt es bei niedrigem Druck (Muskel) effizient ab
Nenne Enzym und kovalent gebundenen Cofaktor
Nenne Enzy und nicht kovalen gebundener Cofaktor
Kovalen
- Pyruvatdehydrogenase mit Liponsäure
- Pyruvatcarboxylase mit Biotin
nicht Kovalent
- Pyruvatdehydrogenase mit Thiaminpyrophosphat
- Cytochromoxidase mit Haem
Netto Edukte und Produkte der Anaeroben Glykolyse
Glucose+ 2ATP + 2 NAD\(^+\) 2 P\(_i\) \(\rightarrow\) 2 Pyruvat + 2 ATP + 2 NADH \(\underrightarrow{-2 NADH}\)
entweder Lactal + 2 ATP
oder bei Hefe 2 Ethanol + CO\(_2 \) + 2 ATP
Was sind die Stark exergone Reaktionen in der Glycolyse
1. D-Glucose mit Hexokinas zu D-Glucose 6-P (1.Schrit mit ATP gebrauch)
2. D Fructose-6-p mit Phosphofructokinase zu Fructose 1,6 bis Phosphat (3.Schrit mit ATP gebrauch)
3. Phosphoenolphyruvat mit Pyruvatkinase zu Pyruvat (letzter Schrit, produzuert ATP)
Netto Edukte und Produkte der Aeroben Glycolyse
Glucose + 2 ADP + 2 NAD\(^+ \) + 2 P\(_i \) \(\rightarrow\) 2 Pyruvat + 2 ATP + 2 NADH
1 Pyruvat produziert über TCC isgesamt 4 NADH, 1GTP 1 FADH\(_2\) (4*2.5+1+1)= 12.5 ATP äquivalente durch Atmungskette
2 NADH = 3-5 ATP äquivalente durch Atmungskette
Total 30 ATP äquivalente (anaeorob nur 2!)
Transport von Acetyl-Coa und NADH zwischen Mitochondrien und Cytosol
.
Wie wird Malat und Aspartat zwischen Mitochondrien und Cytosol Transportiert?
.
Was ist eine Anaplerotische Reaktion?
Nenne Beispiele (3)
Auffüllreaktion für den TCA-Zyklus. Intermediate welche z.B füt Fettsynthese oder A.S gebraucht werden werden nachgeliefert. Surch produktion von Oxaloacetat oder Malat durch Pyruvat respektive Phosphoenolpyruvat.
Bsp:
- Malatenzym: Pyruvat \(\rightarrow \) Malat
- Purucatcarboxylase: Pyrucvat \(\rightarrow \) Oxaloacetat
- PEP-Carboxylase: PEP \(\rightarrow \) Oxaloacetat
Wie viele ATP-Äquivalente gewinnt man durch den Abbau aus Myrisoyl-CoA (14 C Atome). Aerob und Anaereob.
Aerob:
6 \(\beta\)-Eliminierungen egiebt 6 NADH 6 FADH\(_2\) und 7 Acetyl-CoA \(= 6*(2.5 +1.5)+7*10 \) = 94 ATP äq.
Acetyl-CoA ergiebt im TCA-Zyklus CO\(_2\) + 3 NADH + FADH\(_2\) + GTP = 10 ATP äq.
Anaerob:
0 ATP äq. da NADH und FADH\(_2\) nicht verwendet werden können.
Unerschiede zwischen Fettsärueaufbau und Abbau. (4)
Abbau:
- Ort: Mitochondrien
- Acyl-Carier: CoA
- e\(^- \)-Carier: FAD, NAD\(^+\)
- Bausteine: Acetyl-CoA
Aufbau:
- Ort: Cytosol
- Acyl-Carier: ACP
- e\(^- \)-Carier: NADP\(^+\)
- Bausteine: Malonyl-CoA (ACP)
Wie funktionier die Glycogen Mobilisation
Glycophosphorylase Spaltet \(\alpha\) 1-4 Bindung und setzt Glucose-1-P frei bis in die nähe einer \(\alpha\) 1-6 Bindung (Seitenast). Danach Spalten Debranching Enzyme bis auf die \(\alpha\) 1-6 Bindung . Diese wird durch Hydrolyse Abgespaltet
Wie funktioniert die Glycogensynthese?
1. Glucose wie wie im 1. Schrit der Glycolyse zu Glucose-6-P (Aktivierung).
2. Glucose-6-P + UTP --> Glucose-UDP +PPi
3. + Glcucogen\(_n\) -->Glucogen\(_{n +1}\)+ UDP
Erste Glucose bindet an einTyrosin, danach werden \(\alpha\) 1-4- Bindungen gebildet. Enzymaktivität bewirkt umhängen einer Kette zu einer \(\alpha\) 1-6 Bindung
Was ist der Unterschied zwischen Phosphorylase und Phosphatase
Phosphorylase katalisiert die Phosphorolyse: Beim Abbau von Glucogen ensteht bereits Glucose-P welches one weitere Aktivierung vür die Glucolyse verwenden Kann. (1 ATP wird eingespart)
Phosphatase Kat. Hydrolyse: Glucose wird durch Wasser gespaltet und es enstteht nur Glucose
Was produziert der Pentosephosphat-Weg?
Glucose-6-p wird zu Ribose-5-P (wichtig für DNA/RNA) und 2 NADPH
Ribose5-P kann anschliesen durch Transketoisomerase und Transaldoisomerase wider zu Glucose-6-P
Was macht die Transaldolase/Ketolase?
Wo wird diese Gebraucht?
Transaldolase: Übertragt eine C3 Gruppe einer Ketose auf eine Aldose
Transketolase: Übertragt eine Ketol (C2) Gruppe Auf eine Aldolase
Penthose Phosphat weg und Calvin-Cyklus
Welche A.S kann dimere Bilden?
Cystein
Weche A.S Fluoresziert?
Try
Welche A.S enthalten Schwefel
Cys, Met
