Biochemie: Aminosäuren

Alanine (Ala)

- Relative Häufigkeit: 7.8%
- pKa der Seitenkette: -

- Eigenschaft: Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette

Valine (Val)

- Relative Häufigkeit: 6.6%
- pKa der Seitenkette: -

- Eigenschaft: Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette

Leucine (Leu)

- Relative Häufigkeit: 9.1%
- pKa der Seitenkette: -

- Eigenschaft: Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette

Isoleucine (Ile) 

- Relative Häufigkeit: 5.3%
- pKa der Seitenkette: -

- Eigenschaft: Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette

Methionine (Met)

- Relative Häufigkeit: 2.2%
- pKa der Seitenkette: - 

- Eigenschaft: Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette

Proline (Pro)

- Relative Häufigkeit: 5.2%
- pKa der Seitenkette: - 

- pKa-Wert der α-NH3+: 10.64 (= Etwas höher als der normale 9.5 Wert)

- Eigenschaft: Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette

Phenylalanine (Phe)

- Relative Häufigkeit: 3.9%
- pKa der Seitenkette: -  

- Eigenschaft: 
       * Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette
       * Hydrophob, aromatisch

Tryptophan (Trp)

- Relative Häufigkeit: 1.4%
- pKa der Seitenkette: -

- Eigenschaft: 
      * Nicht-polare (ungeladene) Seitenkette
      * Massenmässig schwerste Aminosäure

Serine (Ser)

- Relative Häufigkeit: 6.8%
- pKa der Seitenkette: -  

- Eigenschaft: 
      * Ungeladene, polare Seitenkette
      * Hydrophil durch Alkoholgruppe
      * Alkoholische Gruppe titrierbar 
      * Populäre AS in vielen Enzymen z.B Esterase (Spaltet Ester)
      * Wirkt bei Enzymen im aktiven Zentrum
      * Wenn die alkoholische Gruppe in Nähe einer Base kommt, wird die alkoholische Gruppe            ihr Proton abgeben und GG der Alkoholgruppe verschiebt sich zur deprotonierten Form.            Serine kann dadurch also auch bei pH 7 sauer werden (pKa Wert verändert sich also!!!)            => Serin kann in Enzymen also sauer sein!!! Obwohl in Wasser neutral. 

Threonine (Thr)

- Relative Häufigkeit: 5.9%
- pKa der Seitenkette: - 

- Eigenschaft: 
   * Ungeladene, polare Seitenkette
   * Hydrophil durch Alkoholgruppe

Asparagine (Asn)

- Relative Häufigkeit: 4.3%
- pKa der Seitenkette: -

- Eigenschaft: 
    * Ungeladene, polare Seitenkette
    * Unter Normalbedingungen NICHT protonier-/deprotoniertbar, da Ressonanzstrukturen vorhanden!!

Glutamine (Gln)

- Relative Häufigkeit: 4.3%
- pKa der Seitenkette: -  

- Eigenschaft: 
   * Ungeladene, polare Seitenkette

Tyrosine (Tyr)

- Relative Häufigkeit: 3.2%
- pKa der Seitenkette: 10.46 (Phenol)

- Eigenschaft: Ungeladene, polare Seitenkette

Cystein (Cys)

- Relative Häufigkeit: 1.9%
- pKa der Seitenkette: 8.37 (Sulfhydryl)
                                   (Nah am neutralen Bereich) 

- Eigenschaft: 
   * Ungeladene, polare Seitenkette
   * Kann als H+ -Donor oder -Akzeptor agieren! 
   * In vielen Enzymen im katalytisch, aktiven Zentrum
   * SH-Gruppe leicht durch Sauerstoff oxidierbar!
   * 2 nebeneinanderliegende Cysteine können nach Oxidation eine Disulfidbrücke (=kov.               Bindung) bilden => Stabilisiert Proteine (z.B Bei DNA-Polymerase)

Lysine (Lys)

- Relative Häufigkeit: 5.9%
- pKa Seitenkette: 10.54 (ε-NH3+)

- Eigenschaft:
    * Charged, polar Side Chains
    * Relativ basische AS
    * Lysine häufig an Oberflächen wobei NH3+ oder ganze Seitenkette rausschaut. 
 

Arginine (Arg)

- Relative Häufigkeit: 5.1%
- pKa der Seitenkette: 12.48 (Guanidino)

- Eigenschaft:
    * Mit geladenen, polaren Seitenketten 
    * Hat Ressonanzstrukturen
    * Gruppe trägt positive Ladung
    * Sehr basisch, bis überschüssiges H+ weg ist. 

Histidine (His)

- Relative Häufigkeit: 2.3%
- pKa der Seitenkette: 6.04 (Imidazole) (Nahezu neutral) 

- Eigenschaft: 
   * Geladene, polare Seitenkette
   * Gesamtruppe positiv geladen
   * Imadizol ist häufiges Molekül als Puffer in der pH-Kontrolle.

 

Aspatic Acid (Asp) 

- Relative Häufigkeit: 5.3%
- pKa der Seitenkette: 3.90 (ß-COOH)

- Eigenschaft: Geladene, polare Seitenkette (-)

Glutaminsäure (Glutamic Acid) (Glu)

- Relative Häufigkeit: 6.3%
- pKa der Seitenkette: 4.07 bzw. 4.00 (γ - COOH) 

- Eigenschaft: Geladene, Polare Seitenkette