Molekularbiologie
4.Semester
4.Semester
Set of flashcards Details
| Flashcards | 106 |
|---|---|
| Language | Deutsch |
| Category | Biology |
| Level | University |
| Created / Updated | 08.06.2022 / 10.06.2025 |
| Weblink |
https://card2brain.ch/box/20220608_molekularbiologie
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| Embed |
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Was ist ein Promotor?
Erkennungsstelle/Bindungsstelle für die RNA Polymerase. Der Promotor ist eine Stelle auf der DNA, der vor einem Genanfang liegt.
Genaufbau der Bakterien:
Auf welcher Untereinheit ist das aktive Zentrum?
beta Untereinheit
Was macht die DNA Ligase?
verknüpft die DNA Stränge
von wo bis wo ist Upstream beim DNA Strang?
-35,-10 Region bis mitte RBS
Wie ist die DNA geladen und zu welchen Pol wandert die DNA?
negativ geladen, wegen Phosphate und wandert deshalb zum positiven Pol
Was ist ori?
Origin of replication
Sequenz der -35 Box?
TTGACA
Sequenz der -10 Box?
TATAAT
Was bedeutet es wenn eine Haarnadelschleife entsteht?
Terminator
Wo ist die Alkohol-Dehydrogenase zu finden? und was macht sie?
im Periplasma!
Oxidation von Ethanol zu Acetaldehyd.
ein Stoppcodon
TAA
Was ist ein Rho-Protein? was macht die?
Termination.
- Rho-Protein besitzt 6 identische Untereinheiten.
- 5'-3'
- trennt die RNA-DNA-Hybrid wodurch RNA freigesetzt wird. unter ATPase-Aktivität.
- Inverted repeats
Wo sind die Proteine mit Disulfidbrücken enthalten?
nur im Periplasma, weil dort die Oxidationsbedingungen vorhanden sind. Im Zytoplasma nicht!
Terminal ?--> Signalsequenz bei Menschen
Terminal ? --> Signalsequenz Hefe
Mensch --> C-Terminal
Hefe--> N Terminal
Wie muss das Gen aufgebaut sein, damit das Protein im Cytosol bleibt?
Promotor, mcs1,nucA,mcs2 --> KEIN SIGNALPEPTID!
Wie muss das Gen aufgebaut sein, damit das Protein sekretiert wird?
Promotor, RBS, SIGNALPEPTID, mcs1,nucA,mcs2,
Wie muss das Gen aufgebaut sein, damit das Protein an Zellwand verankert wird?
muss cwa beinhalten und signalpeptid.
Was ist eine Sortase?
Aufgabe: die sezernierte Proteien in der Peptidoglycanschicht zu verankern, LPSTG erkennt die Sortase. kann man mit Nuklease-plate-assay zeigen.
Auf was wirkt das Fosfomycin?
MurA und MurB
Wo findet die Biosynthese von Peptidoglykan statt?
im Cytosol
Gram positive Zellwand, Bestandteil?
grosse Mureinschicht und 1x Plasmamembran
Zellwand der gram negativen Zellen?
kleinere Mureinschicht, 2x Plasmamembran
In welcher Richtung verläuft die DNA Synthese?
5'-3'
Wie wird der codogener Strang DNA aufgebaut?
DNA ein T bei mRNA ein U
Genaufbau Eukarya
Transkriptionsfaktor TFIID Funktion?
bindet an TATA Box und interaiert mit regulatorischen Faktoren
Transkriptionsfaktor TFIIF Funktion?
Bindet an RNA Polymerase 2 und bringt RNA Polymerase 2 zur TATA Box und zu den anderen Transkriptionsfaktoren.
Transkriptionsfaktor TFIIH Funktion?
Helicase Aktivität (DNA-Einzelstrang)
Kinase Aktivität
Phosphorylierung der RNA Poly2 am C Terminus.
Was bedeutet Spleissen?
entfernen der Introns. passiert bei Translation, mRNA ist dann ohne die Introns!!!
Genaufbau von Eukarya! Genaue Reihenfolge!
Promotor-5'UTP-Exon1-Intron1-Exon2-Intron2-Exon3-3'UTR-poly-A-Signal
Achtung: 3 Exons und 2 Introns!!
Achtung. Eukarya haben statt RBS die Cap Struktur!
Wo und wie wird die Cap Struktur angehängt?
enzymatisch an 5' Ende
Warum ist die DNA um Histone gewickelt?
DNA negativ geladen, Histone psositiv.
Was machen die Activators?
regulatorische Transkriptionsfaktoren (RTFs) bezeichnet
und wirken als Aktivatoren oder Repressoren.
Ohne die gäbe es keine Transkription
Was passiert bei einer Transkriptionsaktivierung?
- Transkriptionsaktivatoren binden am Enhancer
- Koaktivatoren werden herbeigezogen und öffnen das Chromatin
- Transkription
- PIC (Preinitiation complex)
- Mediatoren werden gebunden
Was passiert bei einer Histone Acetylierung?
die positive Ladung wird gesenkt, somit sinkt die Affinität für die DNA und das Chromatin öffnet sich. für die Transkription.
Was macht die GLP?
bindet, Adenlyatcyclase aktiviert, produziert cAMP von ATP, aktiviert Proteinkinase, phosphoryliert Transkriptionsaktivator und bindet and TFIID--> transkribiert Insulin.
Die Bindung von Gal80 (regulatorisches Protein) bindet und blockiert die Aktivator-Domäne. Was muss an Gal80 gebunden werden, damit Gal80 nicht mehr blockiert?
Gal3
Warum kultiviert man Hefe mit X-Gal?
für die Blaufärbung wenn Beta Galaktosidase vorhanden ist.
Was ist das yeast two hybrid system?
Um Wechselwirkungen zwischen Proteinen festzustellen,
nutzt man das yeast two hybrid-System.
Grundlage ist der Transkriptionsfaktor Gal4, der in Gegenwart von Galactose einige Gene des Galactosestoffwechsels von Saccharomyces cerevisiae anschaltet.
Man führt in die Hefe ein Reporterkonstrukt
ein, das aus dem Gen für die β-Galactosidase besteht,
das unter der Regulation eines Gal4-induzierbaren
Promotors steht. Das Genprodukt, die β-Galactosidase,
lässt sich leicht im Farbtest nachweisen. Wenn sie blau leuchten--> weiss man dass sie binden.
Wenn keine Wechselwirkung --> Protein bleibt weiss
