4.Semester


Set of flashcards Details

Flashcards 106
Language Deutsch
Category Biology
Level University
Created / Updated 08.06.2022 / 10.06.2025
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https://card2brain.ch/box/20220608_molekularbiologie
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Aus was besteht Gal4?

 

Aktivator Domäne und DNA Bindundedomäne

Wann ist eine Hefe prototroph?

wenn sie alle Aminosäuren und Basen selbst herstellen kann.

Was heisst zB leu2?

der Stamm ist leu2 auxotroph und kann nur wachsen wenn Leucin2 hinzugegeben wird. 

Wie kann man einen his3 auxotrophen Stamm HIS3 prototroph werden lassen?

indem man dem Stamm das Reportergen HIS3 induziert

Wie reguliert die bakterielle Zelle die Tetrazyklin Resistenz?

Sie pumpt das Tetrazyklin mit einer Effluxpumpe raus.

Der Repressor (tetR) ist an tet- Operator gebunden, wenn kein Tetracyclin vorhanden ist. --> zum Energie sparen.

tet-On System:

in Anwesenheit von Tetracyclin erfolgt die Transkription.

(ACHTUNG TET ON TET OFF IN EUKARYA!!))

Tetracyclin bindet rtTA Transkriptionsfaktor und lässt die DNA an den Promotor binden. Die Genexpression findet statt.

tet Off System?

in Abwesenheit von Tetracycline erfolgt die Transkription! --> wenn Tetracycline nicht vorhanden!

also Zugabe von Tetracyclin verhindert also die Genexpression!

Genexpression wird inhibiert, tTA bindet nicht an RNA Polymerase.

Wie sieht ein Eucarya Gen aus mit dem tetO2 Sequenz?


 

Aus wie vielen Tet-Operator 2- Sequenzen besteht das Tetracycline response element?

aus 7 Tet-Operatpr 2-Sequenzen

Welche Anticancerfunktion funktioniert mit tet-On und tet-Off System?

FGFR1 = Fibroblast growth factor receptor like protein (Tumorsuppressor)

(interagiert mit der extrazellulären Matrix,die an anderen Zellen gebunden ist, um die Zelladhäsion zu fördern)


 

 

Aufbau von lac Operon

 

CAP BS- Promotor-Operator-lacZ-lacY-lacA-Terminator

lacZ= beta-Galactosidase spaltet Lactose in Glucose und Galactose

lacY= Galactosid-Permease: Transporterprotein für Lactose in das Zellinnere

lacA= glactosidase acetyltransferase

Was ist lac1? was bildet lac1?

lac1 ist unabhängig und nicht reguliert. lac1 ist in unmittelbarer Nähe von lac Operon. Der bildet/codiert den Supressor!

Supressor: P-lac1-T (siehe bild)

Was ist ein Induktor für den Repressor vonm lac Operon?

Allolactose --> Übergangsprodukt, das die beta Galaktose binden kann.

Wie funktioniert die negativ Kontrolle bei lac Operon?

Regulation durch Repressor. lac Operator bindet an Repressor und es findet keine Transkription statt.

wenn Repressor an Operator bindet keine Transkription! Jedoch bindet Repressor nicht an Operator wenn der Induktor (Allolactose/IPTG) gebunden wird.

Wie sieht der Induktor beim lac Operon aus?

Wie sieht IPTG aus? Was ist die Abkürzung?

Isoprppyl Thiogalactoside (IPTG)

Wie sieht die Sturktur vom lac Operon aus?

als Tetramer

Wie funktioniert die positiv Kontrolle vom lac Operon?

  • Repressor darf nicht gebunden sein
  • Induktor (cAMP) bindet an CAP (catabolite activator protein) BS, (CAP muss vorhanden sein) 
  • RNA Polymerase wird somit aktiviert
  • Transkription

Warum wird Glucose vor Lactose bevorzugt und wie funktioniert das?

- Glucose ist für die Zelle einfach zu verwerten und spart Energie.

Glukose kommt in die Zelle durch ptGS rein,

IIA wird phosphoryliert zu IIA-P und das P wird auf Glukose übertragen. Wenn jedoch das phosphorilierte IIA-P nicht auf die Glukose übertragen werden kann, hemmt sie die Lactose Permease und die Lactose kommt nicht mal in die Zelle rein. Permease wird durch IIA blockiert.

(IIAglc-P ist ein Glucose-spezifische Phosphotransferase Protein.)

Wenn Glucose nicht mehr vorhanden:

IIAglc-P kann das P nicht mehr auf Glukose übertragen und IIA-P blockiert die Lactose Permease nicht mehr.

IIAglc-P aktiviert die Adenylcyclase, ATP wird zu cAMP--> Induktor! CAP bindet cAMP!

 

Fazit: 

  • IIAglc-P --> blockiert die Lactose Permease nicht, cAMP(Induktor) wird aktiviert
  • IIAglc    --> blockiert die Lactose Permease, da P an Glukose gegeben wurde.

Was passiert wenn Glucose als C-Quelle vorhanden aber keine Lactose vorhanden?

Repressor hat gebunden, sitzt am Operator

Was passiert wenn keine Glucose vorhanden aber Lactose als C-Quelle?

Allolactose bindet am Repressor.

Was passiert wenn sowohl Glukose als auch Lactose als C-Quelle vorhanden sind?

  • Repressor an Operator gebunden
  • lactose-permease durch IIA gehemmt
  • Adenylcyclase nicht aktiviert
  • wenn glucose aufgebraucht ist
  • IIAP wieder vorhanden, da P nicht an Glukose abgegeben werden kann
  • Lacotse Permease wird nicht mehr blockiert
  • Adenylcyclase wird aktiviert, cAMP wird produziert, das an CAP bindet, CAP and CAP BS, RNA Polymerase wird aktiviert und die Transkription fängt an mit lacZ,lacY,lacA..

 

Zeichnung der negativ und positiv Kontrolle: Transkription

Zeichnen sie das lac Operon im transkribierten Zustand unter Einfluss der Glukose

 

PCR?

Hitzestabile DNA-polymerase. --> DNA Replikation

Taq?

Thermus aquaticus

Phusion

künstich hergestellt: Pyrococcus-ähnlichen Polymerase mit einer Domäne, die die Prozessaktivität erhöht, proof reading.

PCR Prinzip?

Denaturiern (94-95°C)

Annealing (50-56°C)

Extending stage (72°C)

 

In welcher Richung verläuft die DNA Replikation?

5'-3'

Wo bindet der forward Primer und wo der reverse Primer?

forward--> unteren Strang

reverse--> oberen Strang

Wie viele Zyklen werden bei PCR erzeugt?

35x --> 235 Kopien werden erstellt.

PCR Temperatur Profil?

 

Berchnung PR Produkt Formel

Xn=X0x(1+E)n

E ist abhängig von den PCR Primern.

Die Wallace Regel:

A,T welche Tempi und GC?

A,T 2°C

GC 4°C

 

Man passt die Primerlänge an, bis sie etwa 4°C Unterschied haben.

Was passiert bei der reverse Transkriptase?

Was ist der Unterschied zum normalen PCR?

mRNA wird durch reverse Transkriptase zu dscDNA

Unterschied: template bei reverse Transkri. --> mRNA

Wie sieht ein DNA-Vektor aus? der generelle Aufbau

Nachteil von His-Tag?

  • keine 100% Reinigung
  • man hat immernoch gewissen AS an N'Terminus, die eventuell stören (Sequenzen vom Vektor)

Wie sieht ein pRSET Vektor aus?

 

Wie ist die Gensequenz von BamH1?

  • GGATCC
  • CCTAGG

Wie ist die Gensequenz von EcoRI?

  • GAATTC
  • GTTAAG

Wie funktioniert die Proteinreinigung mit His-Tag?

  1. Protein auf die Säule geben. Säule hat Ni2+ -> Ladung!
  2. Die Proteine binden an der Säule
  3. mit Imidazol eluieren, Lipase kommt durch
  4. Imidazol durch Dialyse entfernen