Biochemie

Citratzyklus, Proteinsynthese, etc

Citratzyklus, Proteinsynthese, etc


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Langue Deutsch
Catégorie Chimie
Niveau Université
Crée / Actualisé 05.01.2021 / 08.02.2021
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STruktur Fettsäuren

Fettsäuren bestehen aus einer hydrophoben Kohlenwasserstoffkette und einer hydrophilen Carbonsäurefunktion

Wie werden Fettsäuren aufgebaut

Aus den C2 EInheiten (Acetyl-CoA) deshalb immer gerade ANzahl an C ATomen zum Beipiel C10, C12, C18

Nomenklatur gesättigte Fettsäuren IUPAC, Trivial und kurz

IUPAC

1. Suche der längsten Kohlenwasserstoffkette im Molekül also auch das C vom COOH Rest wird gezählt.

2. Griechisches Zahlwort + Endung säure

 

Nomenklatur ungesättigten Fettsäuren kurz, lang nach IUPAC

1. Man zählt von hinten also vom COOH Rest hier auch wieder das C vom COOH als 1 bis zur ersten Doppelbindung  z.B. 9 Stelle

Unterscheidung cis und trans 

zb 9 cis Octadecensäure also 18 C ATome en / dien / trien bei einer, zwei oder drei Doppelbindungen

Andere Omega Zählart

CH3 beginnend 

Übung ungesättigte Fettsäuren

Was sind essentielle Fettsäuren?

Omega 3 und 6 Fettsäuren können wir nicht selbst synthetisieren und müssen diese über die Nahrung zu uns nehmen.

Was sind Wachse?

Funktion und Eigenschaften

Wachse sind langkettige Alkohole welche mit langkettigen Fettsäureketten verestert wurden.

Sehr viele C2 Einheiten

 

Funktionen:

Energiespeicher (Plankton)

wasserabweisend Baustoff für Bienen

Wasserabweisende Körperoberfläche (Wasservögel, Blätter)

 

Eigenschaft

Wasserunlöslich

bei Raumtemp fest Schmelzpunkt bei ca. 60-100 Grad

Was sind Triacylglycerine?

Funktion

3 wertiger Alkohol ist mit 3 Fettsäureketten verestert

Als Öltröpfchen im Cytosol

Funktion:

-Speicherfett

-Isolation gegen Kälte

-Wasserunlöslich -> also kein Hydratwasser leichter als Polysaccharidspeicher!!

gering oxidierte C-Atome -> hoher Energiegehalt  (15 bis 20 kg liefert Energie für mehrere Wochen bis Monate)!!!!

Wenn man den Energiespeicher mithilfe von Glykogen anlegen möchte benötigt man ca. das 5fache an Gewicht also 100kg

 

Goldregenpfeifer :D warum braucht der Energie?

Ist ein Zugvogel er legt bis zu 4000 km über das Meer ohne Nahrung

Er hat Fett eingelagert um dies zu schaffen

Wie ist die Energieverteilung eines Menschen mit 70 kg?

Glukose (Blut) 170 kj

Glykogen (Leber und Muskeln) 2.500 kj

Proteine (Muskulatur) 100.000 kj

Triacylglycerin (subcutan und visceral) 420.000 kj

21 kg Also oben genannte Stoffe und Knochen etc. -> durch die Evolution sehr gut entwickelte Energiekomprimierung

davon 49 kg Wasser (70%) keine Energie

Pottwale haben ein Spermaceti Organ welches ca 4 Tonnen Walratöl produzieren. Wozu dient das Organ

 

Jagdgebiet der Pottwale in Tiefen jenseits der -1000 Meter

Walratöl bei 37 Grad flüssig (geringe Dichte) und bei kleiner als 31 Grad kristallin (große Dichte)

Also im tiefen Wasser hat es eine höhere Dichte somit muss er keine Energie aufwenden um unten zu bleiben

Regulation von Glykolyse und Gluconeogenese

Glykolyse und Gluconeogenese sind quasi entgegengesetzte Mechanismen und können durch verschiedene Produkte innerhalb des Zyklus gehemmt oder aktiviert werden, je nachdem was der Körper gerade zu viel hat und was er braucht.

Bsp.: Citrat --> kann Glykolyse hemmen und dementsprechend die Gluconeogenese aktivieren

Bsp.: ADP --> kann Glykolyse fördern und Gluconeogenese hemmen

Warum sind die Lipide strukturgebend?

Beispiel!

In einer Phospholipid Doppelschicht sind im inneren hydrophobe und außen hydrophile Bestandteile. Somit strukturgebend der Layer ist beweglich, also können die einzelnen Membranlipide sich auch in der Schicht bewegen (dynamisch), 

Ohne Lipide würde der Glykolyse, die Atmungskette etc. nicht funktionieren!!

Wie wird die Blutglucosekonzentration kontrolliert?

durch Glykolyse und Gluconeogenese. Wenn die der Glucosespiegel zu hoch ist, wird Insulin ausgeschüttet, was eine Phosphatase aktiviert.

 Membranfunktionen?

Nennen Sie Membrane

Membranen können beliebig verschmelzen 

- wichtige Transportfunktion größere Teilchen durch die Plasmamembran bei Exozytose und Endozytose

- wichtige Transportfunktion innerhalb der Zelle

- für Ionen und polare Moleküle weitgehend undurchlässig

-Wasser kann relativ leicht passieren

-Im Labor kann man die Leitfähigkeit messen, somit hat man herausgefunden das Natrium und Kalium länger braucht als Wasser um hindurch zu diffundieren


Zellkernmembran, Mitochondrialen Membran usw

Wo wird der Schmelzpunkt reguliert?

mehr gesättigte Fettsäuren führt zu einer höheren Dichte also einen höheren Schmelzpunkt

niedrigere Temp dann muss die Membran beweglich bleiben also hoher Anteil an ungesättigten Fettsäuren (diese haben einen tieferen Schmelzpunkt)

Wirkungsweise von Insulin und Glucagon

Insulin senkt die Blutzuckerkonzentration und Glucagon erhöht ihn.

Insulin aktiviert Phosphatase, welche ein multifunktionelles Enzym (PFK-2/FBPase-2) dephosphoryliert (eine Phosphatgruppe entfernt). Kinase-Teil von PFK-2/FBPase-2 wird aktiv, was dazu führt, dass in der Glucolyse aus Fructose-6-Phosphat Fructose-2,6-bisphosphat gebildet wird.

Glucagon aktiviert den Phosphatase-Teil von PFK-2/FBPase-2, was dazu führt, dass Fructose-2,6-bisphosphat wieder zu Fructose-6-phosphat wird.

Fett für Energie und Stoffwechselprodukte

Abbau bis zu C2 Fragmenten (Acetyl CoA -> Citratzyklus

Aufbau aus C3 Fragmenten (Malonylgruppen) unter CO2 Abspaltung

Energiebilanz bei der Erzeugung aus C16 Palmitat

WIe viel ATP kann der Körper daraus herstellen

106 ATP

Was sind Enzyme?

ENZYME sind Proteine, die biologische Reaktionen beschleunigen (biochemischer Katalysator)

-können pro Enzymmolekül bis zu hunderttausende Moleküle pro Sekunde umsetzen

-werden nicht verändert

-sind aber empfindlich (Temperatur, pH Bereiche, Substratkonzentration, Inhibitoren)

WO werden Enzyme eingesetzt?

Bier, Wein Käse Brot Produktion

Papierherstellung

Lederherstellung

Zahnpasta

ohne ENzyme würde sehr viel fehlen eigentlich alle verarbeiteten LM im Supermarkt

Jeans Biotreibstoff

Waschmittel!!!

Aufbau PFK-2/FBPase-2

besteht aus zwei Teilen

1. hat Kinase-Aktivität, kann also andere Proteine phosphorylieren

2. hat Phosphatase-Aktivität, kann also dephasphorylieren

ist das Enzym selbst phosphoryliert, hat es Phosphatase-Aktivität. Ist es selbst dephosphoryliert, dann hat es Kinase-Aktivität

Was ist an Enzymen so besonders

beschleunigen Reaktionen um den Faktor Billiarden also 10^17

umweltfreundlich bio. abbaubar

milde Reaktionsbed. pH 5-8 20 bis 40 Grad in der Regel. Natürlich höher und niedriger

meist in wässriger Lösung anwendbar

können hochspezifisch sein

können aber auch mit vielen Ausgangsstoffe zurechtkommen 

7 biochemische Klassen Klassen von ENzymen 

Oxidation / Reduktion

Gruppenübertragungsreaktion

Hydrolysen

Addition / Abspaltung Doppelbindungen

Isomerisierung

Ligation c-c Bindungsknüpfung

Transport

EC Nummern bei den Enzymen

Grundprinzip der Enzyme

Nach dem Schlüssel Schloss Prinzip werden die Endprodukte umgesetzt Enzym geht unverändert aus der Reaktion hervor.Substrat kann andocken und wieder unverändert hinaus diffundieren wenn die Zeitkonstante nicht erreicht wurde um das Substrat zu spalten

Die grüne Fläche soll das aktive Zentrum sein

Anpassung des aktiven Zentrum an das Substrat (induced fit) Die Struktur ist nicht genau vordefiniert, sobald sich das Substrat nähert passt sich das aktive Zentrum an.

In der Realität meistens Mischformen

 

pH und Temperatur Optimum eines Enzyms

Beispiel eines Graphen 

Was versteht man unter der Enzyminhibierung

Änderung der Enzymstruktur somit Verlust der Fähigkeit etwas zu katalysieren

Unterteilung in reversibel und irreversibel

Erklären Sie die Kompetitive Enzyminhibierung

kompetitiv = Wettbewerb um die Bindungsstelle zwischen Substrat und Inhibitor

Nicht kompetitive Inhibierung?

Allosterische Zentrum wird gebunden Konformationsänderung an der Substratbindungsstelle

Substratüberschuss?

Produktüberschusshemmung?

Wie baut der Körper neue Proteine?

"Bauplan" für die Proteine  liegt auf der DNA bzw. auf den Genen. Durch die Transkription wird eine RNA des entprechenden Gens auf der DNA gebildet. Gene können grundsätzlich in beide Richtungen abgelesen werden (weil DNA Doppelstrang ist)!. Anschließend wird in der Translation aus dieser RNA bzw aus der INformation auf der RNA eine AS-Kette gebildet, aus der dann ein Protein entsteht.

Dabei gibt es für jede AS ein oder mehrere Tripletts auf der RNA, das für die AS codiert. kann mit der Code-Sonne abgelesen werden.