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Set of flashcards Details
| Flashcards | 23 |
|---|---|
| Language | Français |
| Category | Medical |
| Level | University |
| Created / Updated | 28.11.2020 / 28.11.2020 |
| Weblink |
https://card2brain.ch/box/20201128_synthese_des_proteines
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| Embed |
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Traduction
= processus par lequel la séquence nucléotidique codante de l'ARNm est utilisée pour relier les AA en une chaine polypeptidique (protéine)
[Réplication] -ADN -[Transcription]-> ARNpré-m - [Maturation] -> ARNm - [Traduction avec ARNt + ARNr] -> Protéine
Dépend de 3 types d'ARN (en plus de nombreuses protéines, TF et AA) :
1. ARNm = porte l'info génétique
2. ARNt = aide à traduire l'info
3. ARNt = idem
Codons start / stop sur l'ARNm
= définit le cadre de lecture
Start :
- typiquement AUG qui code pour la Met N-terminale (= ATG sur ADN)
Stop:
- 3 codons de fin de trad. qui ne code pas pour des AA = UAA / UAG / UGA => marquent le C-terminal
ARNt
= adaptateurs clés pour la lecture des triplets de nucléotides comme les AA
Fonction = déchiffrer des condons d'ARNm
Structure :
- petits (73 - 93 nucléotides)
- hélices double brin
- 3 boucles
- le site 3' accepteur de AA a une séquence CCA qui s'ajoute après la synthèse
Structure de ARNt
Hint : 3.5 boucles
-> chaque boucle à sa fonction précise
Types de modifications de nucléotides dans ARNt (4)
1. Méthylation ou diméthylation
2. Réduction de doubles liaisons
3. Substitutions dans l'anneau pyrimidine
4. Désamination
=> peuvent changer les partenaires ou l'affinité de l'interaction
Etapes du déchiffrage du code génétique par ARNt (2)
1. Couplage spécifique d'un AA à son ARNt via l'enzyme aminoacyl transférase spécifique -> liaison ester
a. Production d'un intermédiaire transitoire aminoacyl-adénylate => AA li par phosphoester à adénylate
b. Transfert de cet AA activé sur le -OH 3' de l'adénosine au 3' de ARNt
-> les deux étapes sont catalysées par l'enzyme synthétase et l'énergie vient de l'hydrolyse de l'ATP
-> Energie vient de la liaison ester
2. Reconnaissance spécifique d'un triplet codant dans l'ARNm par un ARNt couplé avec un aminoacyl via le ribosome
-> ARNt chargé se lie avec son anticodon au codon complémentaire sur ARNm (via ribosome)
3. Ribosome utilise AA -> ARNt donne son AA pour prolonger le polypeptide naissant -> ARNt quitte le ribosome et ARNm est désagrégée
Reconnaissance de l'ARNt approprié par la synthétase
-> synthétase lie deux régions de l'ARNt
1. Souche acceptatrice (CCA) pour la conjuguaison de l'AA
2. Boucle anticodon pour reconnaissance spé. d'ARNt ou autre région caractéristique d'un ARNt
-> va ensuite trier les AA suivant leur taille et/ou les groupements fonctionnels de l'AA
ex. Ser = OH + NH3 ; Thr = OH + NH3 + CH3 etc
Ribosomes - Définition + Composition + Fréquence + Localisation + Fonctions
Définition = complexes ribonucléoprotéiques (ARNr et protéines)
Composition = 3 (bactéries) ou 4 (eucaryotes) molécules différentes d'ARNr (60% masse) + 80aine de protéines associées plus ou moins étroitement (40% masse)
=> forment 2 sous-unités : Eucaryotes : grande (= 60 S) + petite (= 40 S) = 80 S // Procaryotes : grande (50S) + petite (30 S) = 70 S
=> structure primaire peut varier selon les organismes mais structure secondaire + tertiraire ne bouge pas
Fréquence = 25% de la masse cellulaire totale
Localisation = soit libre dans le cytoplasme (= génération de protéines qui restent à l'intérieur de la cellule) ou soit associés au RER (= génération de protéines membranaires / sécrétées via Golgi / pour endosomes ou lysosomes ou RER)
Fonctions enzymatiques = catalyseur de la synthèse polypeptidique (grand ARNr est une peptidyl transférase -> aucune protéine n'est présente au niveau du site catalytique) :
1. Association avec ARNm -> migration le long du brin
2. Fixation 2-3 ARNt chargés d'AA et d'autres protéines
3. Catalysation de la polymérisation des chaines d'AA
Fonctions non-enzymatiques :
1. Localisation d'un site correct d'initiation avec l'ARNt sur l'ARNm + maintien du cadre de lecture
2. Stabilisation de la liaison -> augmente les proba. de liaison initiale des ARNt chargés à leur triplets correspondants sur l'ARNm
3. Inhibition de l'hydrolyse spontanées -> le lien ester AA activé <-> ARNt est instable -> pas de H2O de la grande ARNr donc pas d'hydrolyse possible
Facteurs tenant au repos les deux sous-unités d'un ribosome eucaryote
eIF6 (grande sous-unité)
eIF3 (petite sous-unité)
eIF = facteurs d'initiation eucaryote
Etapes de la traduction (3)
1. (Pré-)initiation
2. Elongation
3. Terminaison
eIF1A + eIF2
1. eIF1A = facteur associé au ribosome 40 S lors de l'initiation
2. eIF2 = facteur associé au GGTP + Met-ARNt => forme Met-2-GTP-ARNt
= le tout forme le complexe de pré-initiation
eIF4
composé de eIF4A - B - G - E
facteur qui s'associe au complexe de pré-initiation et se fixe sur l'extrémité 5' d'un ARNm (= coiffe m7 Gppp)
hélicase eIF4A -> défait les stuctures secondaires de l'ARNm (via consommation d'ATP)
Séquence Kozak
5'- ACCAUGG - 3'
-> AUG = start
-> 5' - A et G - 3' sont les nucléotides déterminants pour l'efficacité de l'initiation => vital pour avoir le cadre de lecture correct
eIF5 + eIF6
facteurs d'initiation permettant l'association du ribosome 60S
eIF5 s'associe à GTP pour l'hydrolyser afin de compléter l'association entre le ribosome 60S et 40S
EF1A
= facteur protéique jouant un rôle clé pour l'élongation
- se complexe avec ARNt-AA en forme active
- protège liaison ester d'une hydrolyse spontanée
- facilite interaction ARNt-AA et ribosome
- si codon match avec anticodon -> hydrolyse le GTP pour changer sa conformation et être relâché du ribosome + changer la conformation du ribosome
EF2
= facteur de translocation associé au GTP
-> son hydrolyse ainsi que celle du GTP en GDP vont aider l'ARNt en A du ribosome à passer en P
eRF 1 + eRF 2 + eRF3
eRF1 et 2 :
- protéines avec une structure similaire à l'ARNt
- reconnaissent les codons stop sur l'ARNm et amènent H2O au centre du ribosome
eRF3 :
- GTPase (= enzyme) -> utilise H2O pour hydrolyser le GTP -> dissociation des composants du ribosome
- associé à eRF1 et au GTP
mTOR
Enzyme protéique (= kinase) activée par les GF et les hormones (ex. insuline) et inhibée par un agent immuno-suppresseur important -> Rapamycine
Fonctionne comme capteur pour mesurer la disponibilité des nutritives et de l'énergie
Contrôle positivement la biosynthèse du ribosome et la formation du complexe d'initiation de la traduction (eIF4E)
Puromycine
= antibiotique
- Structure similaire à l'extrémité 3' de AAc-ARNt
-> se fixe au site A du ribosome
-> empêche l'entrée d'un AAc-ARNt normal
-> son AA est transféré au groupe carbony du polypéptide => terminaison prématurée de la protéine
Hsp70 - ATP
= protéine de choc thermique qui se lie à de l'ATP
-> se lient aux chaines polypeptidiques à la sortie du ribosome -> captation des régions hydrophobes
-> les empêche de s'agréger et d'être rendue non fonctionnelles
GroEL (procaryotes) / Hsp60 (eucaryotes)
= protéines qui forment un baril annulaire à 7 membres dont les deux extremités sont formées de 7 molécules chacune de Hsp10 / GroES
-> protège les protéines à la sortie du ribosome pour permettre un bon repliement
Mécanismes de dégradation des protéines (2)
1. A travers les lysosomes (= organelles remplies d'enzymes hydrolytiques (protéases))
- prot. transmembranaires et extracellulaires endocytosées
- prot. d'organelles agées ou défectueuses
2. Par la voie ubiquitine-protéasone
- prot. cytosoliques intracellulaires avec une stabilité régulée
- prot. mal rempliées pdt la sythèse
Prion disease
prions = prot. mal pliées, présentes dans l'organisme et qui forment des agrégats anormaux (= amyloïdes) -> s'accumulent dans les tissus infectés -> associés à lésions tissulaires et mort cellulaire
Ex.
1. Maladies dégénératives :
- Alzheimer's
- Parkinson's
- Diabète type II
- Dégénérescence maculaire liée à l'âge
-> communes mais encore incurables -> prévention uniquement
