Molekularbiologie
Universität zu Lübeck, Modul LS 3151 Molekularbiologie für Nebenfächer (Bioinformatik, MI)
Universität zu Lübeck, Modul LS 3151 Molekularbiologie für Nebenfächer (Bioinformatik, MI)
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Lernkarten
Telomerproblem
Lösung bei Keimzellen
Verlängerung durch Telomerase
Telomerase
- Hybridisierung an TTG des Folgestranges
- DNA Polymerisation nach RNA Matrize um 6 bp
- Translokation und Wiederholung des Vorgangs
- Herstellung des Folgestranges durch Primase und DNA Polymerase
Protein
Funktion
- Grundbausteine der Zelle
- wesentlich für Struktur und Funktionen der Zelle
RNA-Spleißen
- Elimination der Introns
- übrige Exons miteinander verbunden
genetischer Code
- Triplett-Code
- degeneriert
- universell
- kommalos
- nicht überlappend
Triplett-Code
3 Basen codieren eine Aminosäure
degeneriert
es gibt mehr Codonen als notwendig
universel
ein best. Basentriplett immer die gleiche Aminosäure
kommalos
kein "Leerzeichen" nach einem Triplett
nicht überlappend
keine Base in zwei Tripletts
Vorteile DNA vs. RNA
- DNA durch Desoxyribose stabiler
- längere Ketten möglich
- robuster durch Thymin
- besser reparierbar
Genregulation
- Zelldifferenzierung entsteht durch unterschiedliche Produktion von RNA- und Proteinmolekülen
- Genexpression
- Genom ändert sich nicht
Genregulation
Genregulatorproteine
- kontrollieren An- und Abschaltung des Gens
- sorgen für Zelldifferenzierung
Genregulation
Modulation der Genexpression
- durch miRNA
- ermöglicht gezielte Expression von Genen
- Zelldifferenzierung
Regulation der Genexpression
Chromatin-Ebene
Heterochromatin <-> Euchromatin
Regulation der Genexpression
DNA-(Gen-) Ebene
Initiation der Transkription
Regulation der Genexpression
RNA-Ebene
- RNA-Processing
- Stabilität
- Transport
- Information
- Initiation der Translation
Regulation der Genexpression
Protein-Ebene
Post-Translatorische Modifikationen
Regulation der Genomaktivität
Transiente Veränderungen
erlauben der Zelle auf externe Stimuli zu reagieren
Regulation der Genomaktivität
Permanente Veränderungen
Differenzierung
Repetitive DNA
- Tandem-repetitive Elemente
- Verstreut-liegende repetitive Elemente
Tandem-repetitive Elemente
Short Tandem Repeats (STR)
Verstreut-liegende repetitive Elemente
- Short Interspersed repetitive Elements (SINEs)
- < 500 bp
- > 105 Kopien
- Long Interspersed repetitive Elements (LINEs)
- > 5 kb
- > 104 Kopien
Mitose
- Kernteilung
- trennt die Chromatiden in zwei identische Hälften
- nicht die homologen Chromosomen
Eukaryotische Replikationsgabel
Problem
DNA-Polymerase kann nur in 5'-3'-Richtung synthetisieren
DNA-Polymerase
- synthetisiert DNA
- vom 5' zum 3'- Ende
- setzt am 3'-Ende an
5' Ende
Phosphodiester
3'-Ende
OH-Gruppe
Leitstrangsynthese
- 5' -> 3' Ende
- Proofreading möglich
Folgestrangsynthese
- 3' -> 5'
- aber auch 5' -> 3' notwendig
- deshalb Primer
- Leitstrangsynthese bis zum nächsten Primer
Didesoxy-Methode
- Synonyme:
- Strangabbruch-Methode
- Sanger-Methode
- Denaturierung
- Aufbrechen Wasserstoffbrückenbindungen
- Annealing
- Anlagerung des Primers
- Extension
- Verlängerung der Stränge
- Gelelektrophorese
DNA Sequenzierung
Radioaktiv
- 4 Ansätze notwendig
- je einen für A,C,G,T
- radioaktives Label wird genutzt
- entweder
- nichtgelabelte Nucleotide und gelabelter Primer
- an Phosphatrest gelabelte Nucleotide und nichtgelabelter Primer
- entweder
DNA-Synthese
dNTP/ddNTP
- dNTP (Desoxyribonukleotid-tri-phosphat) nötig
- als Baustein für neuen Strang
- ddNTP bewirkt Stopp der Synthese
- 2,3 Didesoxyribonukleotid-tri-phosphat
- 3'-OH Ende fehlt für Synthese
Gelelektrophorese
- Puffer innen und außen
- Kathode oben am Gel
- Anode unten im Behälter
- DNA zur Anode
DNA Sequenzierung
Fluoreszenzfarbstoffe
- prinzipiell analog zur radioaktiven
- ABER nur noch 1 Ansatz nötig
- verschiedene Farbstoffe für A,C,G,T
- schneller (nur noch eine Gelbahn)
DNA Sequenzierung
Kapillarelektrophorese
- Fluoreszenzfarbstoffe
- ohne Gel
- Laser beschießt Fluss
- Fluoreszenzdetektor schreibt Base mit
DNA-Klonierung
Zweck
Vervielfältigung eines bestimmten DNA-Fragments
DNA-Klonierung
Plasmidvektoren
- aus Plasmiden gewonnene Vektoren
- leicht in größeren Mengen gewinnbar
- unabhängige Replizierung
- aber geringe Kapazität
- bis max 20kB