Biochemie
Klausuraufgaben
Klausuraufgaben
Woher stammen die N- Atome im Harnstoff?
die N Atome stammen aus AS und werden in Form von NH3 von diesen auf Alpha Ketoglutarat übertragen und über Carbamoyl Phosphate an den Harnstoff weitergeleitet
Wie kann die Größe eines Plasmide bestimmt werden?
mittels Agarose - Gelelektophorese
durch einen Marker DNA können am Gel später die Fragmentgrößen abgelesen werden
Weshalb sind kleinere DNA Fragmente in Ethidiumbromid gefärbten Agarosegewlen schlechter sichtbar als die gleichen Molmengen großer Fragmente?
-kleine Fragmente können nur wenig Ethidiumbromid zwischenlagern
Weshalb wird zur eletrophoretischen Auftrennung von RNA Formaldehyd zugesetzt und weshalb ist dies bei dsDNA nicht notwendig?
-RNA ist einzelsträngig und kann mit sich selbst Rückfaltungen bilden, die das Laufverhalten im Gel ändern -> dadurch keine Aussage über Fragmentgrößen möglich
-Formaldehyd denaturriert RNA-Sekundärstrukturen/ Rückfaltungsstrukturen werden also durch Formaldehyd unterbunden
-dsDNA: weniger freie Gruppen zur Sekundärstrukturbildung.
Definieren sie die Michaelis Konstante KM!
entsapricht Substratkonzentration bei der die Hälfte der Substratbindungsstellen des Enzyms besetz sind
Welche Parameter können aus KM abgeleitet werden?
Zeiochnen Sie Vmax und Km in einem Michaelis-Meten-Diagramm ein!
...
Welche Aussagen können aus KM abgeleitet werden?
Malonat inhibiert den Citrat Zyklus. Erklären sie das!
- Malonat = Discarbonsäure
- hemmt die Succinat Dehydrogenase als kompeteiver Hemmer
- bindet an die succinat dehydrogenase am aktiven zentrum und hemmt diese
- Succinat und Malonat ähneln sich in ihrer struktur (Homolog), es kommt zu Konkurrenz um das aktive Zentrum
Welches ist der grundlegende Unterschied in der Synthese der Purtine und der Pyrimidine?
Welche Form der Ribose wird für die Nukleotidsynthese benötigt?
- Pyrimidine: startet mit der Ringbildung, Zuckerbestandteil wird später kondensioert
- Purin: Nukleotidsynthese startet mit Zucker, es wird eine aktive Form von Ribose benötigt
Welchen weg gehen die Elektronen aus dem wasser? (Thema: Wasseroxidation PSII)
- wandern von Eletronenlücke PS 680 durch die Reduktion von Plastochinon in den Cytochrom Komplex
-wandern vom Cytochrom Komplex weiter zu Plastocyanin an das Reaktionszentrum P700 im PSI
Wie lautet die eingangsreaktion des Calvion Zyklus und welche AS wird im Peroxisom generiert?
- Carboxylierung -> Rubisco Katalyse
- im Peroxisomen wird Glycin generiert
Folgende Enzyme sind bei der Replikation von DNA beteiligt!
Welche katalytischen Aktivitäten sind mit der DNA Polymerase assoziiert?
Welche Klassen von Enzymen sind richtig?
Zu welcher Enzymklasse gehört die Argininsuccinatlyase?
Zu welcher Enzymklasse gehört: Ornithin Transcarbamylase?
Melelson- Stahl- versuch
Welchen weg ist der N gegangen, um letztlich in DNA eingebaut zu werden? Welche Enzyme waren vermutlich daran beteiligt?
- N wird durch Nitrogenase zu NH3
- Glutaminsäure wird durch Glutamin Synthetase zu Glutamin
- Purin wird in DNA durch NDA Pol III eingebaut
Wo finden sie das C14 Atom in einer mit diesem Malonyl CoA synthetisierten Fettsäure?
- an der dritt letzten Stelle
Vergleichen sie die Beta Oxidation mit der fettsäure Biosynthese. Wo sind Unterschiede?
- Lokalisation: Beta Oxidation im Mitochondrium, FA Biosynthese im Cytosol
- Verknüpfung des Acyls mit einem träger
- Elektronen Akzeptor
- Bereitstellung des C2 Einheiten
Wie ist die Oxidationszahl definiert?
Zeichnen Sie die folgenden Verbindungen und bestimmen Sie die Oxidationszahl aller C-Atome: CH4, CH3OH, HCOOH, CO2, CH3CH2OH, H3C-COOH
CH4: -4
CH3OH: -2
HCOOH: +2
CO2: +4
CH3CH2OH: -4
H3C-COOH: 0
Zeichnen Sie ein Adenosin-Triphosphat und ein Adenosin-Diphosphat.
....
Wie nennt man die Bindungen, die das Nucleosid mit dem Phosphat verknüpfen, welche sind besonders energiereich?
Phosphorsäureester-Bindung
Phosphorsäureanhydrid-Bindung (bei Tri 2x, bei Di 1x)
Zeichnen sie eine Peptidbindung!
....
Peptidbindung: Kann das Molekül um diese Bindung rotieren? Warum?
Peptidbindung: entsteht wenn Aminogruppe + Carboxylgruppe miteinander reagieren
keine freie Rotation, nur im gewissen Winkel -> weil Resonanzstruktur Zwischen O und N
Eigenschaften von Aminosäuren, woraus ergeben sich die Ladungen?
-Bestandteile der Peptide und Proteine
-Zwischenprodukte metabolischer Abläufe
-Neurotransmitter
-Jedes Protein hat einen pH-Wert
-AS+basische Seitenkette: Pos. geladen
-AS+saure Seitenkette: neg. geladen
Was ist der isoelektrische Punkt?
Was ist ein Co-Faktor?
Was ist ein Co-Enzym?
Was ist eine Prosthetische Gruppe?
Was ist der Unterschied zwischen einem Apo- und einem Holoenzym?
Nennen Sie drei Co-Enzyme und beschreiben sie deren Aufgabe in der Katalyse!
-Biotion: bei Carboxylierungsreaktionen, Beteiligung an der Histonmodifikation
-Häme: bildet mit Globin das Hämoglobin
-Flave: Bestandteil von Wasserstoffübertragenen Enzymen, Bedeutung im Stoffwechsle der Zelle für Atmung
Zeichnen Sie ein Reaktionskoordinatendiagramm! Achten sie dabei auf: Übergangszustand, Aktivierungsenergie und Delta G)
...
Warum sind Lipide bessere Energiespeicher als Kohlenhydrate?
Welche Reaktionen des Citrat-Zyklus gibt es?
Bei der Citratsynthese...
Bei der Aconitase
Bei der Isocitrat - Dehydrogenase...
Bei der Ketoglutaratdehydrogenase....
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Lernkarten
Woher stammen die N- Atome im Harnstoff?
die N Atome stammen aus AS und werden in Form von NH3 von diesen auf Alpha Ketoglutarat übertragen und über Carbamoyl Phosphate an den Harnstoff weitergeleitet
Wie kann die Größe eines Plasmide bestimmt werden?
mittels Agarose - Gelelektophorese
durch einen Marker DNA können am Gel später die Fragmentgrößen abgelesen werden
Weshalb sind kleinere DNA Fragmente in Ethidiumbromid gefärbten Agarosegewlen schlechter sichtbar als die gleichen Molmengen großer Fragmente?
-kleine Fragmente können nur wenig Ethidiumbromid zwischenlagern
Weshalb wird zur eletrophoretischen Auftrennung von RNA Formaldehyd zugesetzt und weshalb ist dies bei dsDNA nicht notwendig?
-RNA ist einzelsträngig und kann mit sich selbst Rückfaltungen bilden, die das Laufverhalten im Gel ändern -> dadurch keine Aussage über Fragmentgrößen möglich
-Formaldehyd denaturriert RNA-Sekundärstrukturen/ Rückfaltungsstrukturen werden also durch Formaldehyd unterbunden
-dsDNA: weniger freie Gruppen zur Sekundärstrukturbildung.
Definieren sie die Michaelis Konstante KM!
entsapricht Substratkonzentration bei der die Hälfte der Substratbindungsstellen des Enzyms besetz sind
Welche Parameter können aus KM abgeleitet werden?
Zeiochnen Sie Vmax und Km in einem Michaelis-Meten-Diagramm ein!
...
Welche Aussagen können aus KM abgeleitet werden?
Malonat inhibiert den Citrat Zyklus. Erklären sie das!
- Malonat = Discarbonsäure
- hemmt die Succinat Dehydrogenase als kompeteiver Hemmer
- bindet an die succinat dehydrogenase am aktiven zentrum und hemmt diese
- Succinat und Malonat ähneln sich in ihrer struktur (Homolog), es kommt zu Konkurrenz um das aktive Zentrum
Welches ist der grundlegende Unterschied in der Synthese der Purtine und der Pyrimidine?
Welche Form der Ribose wird für die Nukleotidsynthese benötigt?
- Pyrimidine: startet mit der Ringbildung, Zuckerbestandteil wird später kondensioert
- Purin: Nukleotidsynthese startet mit Zucker, es wird eine aktive Form von Ribose benötigt
Welchen weg gehen die Elektronen aus dem wasser? (Thema: Wasseroxidation PSII)
- wandern von Eletronenlücke PS 680 durch die Reduktion von Plastochinon in den Cytochrom Komplex
-wandern vom Cytochrom Komplex weiter zu Plastocyanin an das Reaktionszentrum P700 im PSI
Wie lautet die eingangsreaktion des Calvion Zyklus und welche AS wird im Peroxisom generiert?
- Carboxylierung -> Rubisco Katalyse
- im Peroxisomen wird Glycin generiert
Folgende Enzyme sind bei der Replikation von DNA beteiligt!
Welche katalytischen Aktivitäten sind mit der DNA Polymerase assoziiert?
Welche Klassen von Enzymen sind richtig?
Zu welcher Enzymklasse gehört die Argininsuccinatlyase?
Zu welcher Enzymklasse gehört: Ornithin Transcarbamylase?
Melelson- Stahl- versuch
Welchen weg ist der N gegangen, um letztlich in DNA eingebaut zu werden? Welche Enzyme waren vermutlich daran beteiligt?
- N wird durch Nitrogenase zu NH3
- Glutaminsäure wird durch Glutamin Synthetase zu Glutamin
- Purin wird in DNA durch NDA Pol III eingebaut
Wo finden sie das C14 Atom in einer mit diesem Malonyl CoA synthetisierten Fettsäure?
- an der dritt letzten Stelle
Vergleichen sie die Beta Oxidation mit der fettsäure Biosynthese. Wo sind Unterschiede?
- Lokalisation: Beta Oxidation im Mitochondrium, FA Biosynthese im Cytosol
- Verknüpfung des Acyls mit einem träger
- Elektronen Akzeptor
- Bereitstellung des C2 Einheiten
