Vertiefungsmodul Programmieren für Biologen Lernkarteien

HHU V-Modul Biologie Bachelor Lernkarten für thereotischen Klausurteil

HHU V-Modul Biologie Bachelor Lernkarten für thereotischen Klausurteil

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About these flashcards

Diese Lernkarten richten sich an Biologie-Studierende, die sich mit Programmierung vertraut machen möchten. Sie behandeln grundlegende Konzepte wie Mengen, Elemente, Objekte, Zahlen und Strings, sowie fortgeschrittene Themen wie reguläre Ausdrücke, Listenverarbeitung und Mengenoperationen. Die Karteikarten helfen dabei, die Anwendung von Methoden und Operatoren in der Programmierung zu verstehen und zu üben, was für die Datenanalyse und -verarbeitung in der Biologie essenziell ist.

Flashcards

47

Students

3

Language

German

Category

Biology

Level

University

Created / Updated

12.06.2022 / 18.06.2023

Suchen und Ersetzen mit Gruppierungen

- innerhalb der Ersetzunf können die Gruppierungen ebenfalls wieder verwendet werden -> wir schreiben dann \1

- also beispielsweise text_neu=re.sub(r"Biologie",r"Germanistik und \1, text)

Output: Marie studiert Germanistik und Biologie

Methode re.split(...)

-ein Teilstring kann über einen regulären Ausdruck angegben werden

Metazeichen Allgemein

-haben eine spezielle Bedeutung trotz regulärem Ausdruck

- will man die Zeichen selber suchen, muss man dann aber \ schreiben

Metazeichen Punkt

meint jedes beliebige Satzzeichen

Metazeichen: [abc]

- nur ein einziges Zeichen aus der Menge wird gesucht

Metazeichen [^ABC]

- ein Zeichen, aber nicht aus der angegebenen Menge

Metazeichen aa|bb

suchen aa oder bb, nicht gemischt

Metazeichen $

Ende der Zeichenkette

Metazeichen ^

Anfang der Zeichenkette

Quantoren: Definition

Quantoren legen fest, wie oft ein Teil eines Ausdrucks hintereinander vorkommen darf beziehungsweise soll

Zeichenklassen

- [0-9] \d \D Ziffer

- [a-Z, A-Z, a-z, 0-9] \w \W Wortzeichen

- [\t \n \r \f ] \s \S Whitespace

Quantor *

beliebig oft das Zeichen, darf auch fehlen, also Leerzeichen sein

Quantor +

mindestens ein Mal

Quantor ?

Einmal oder Keinmal

Quantor {Zahl}

Muss genau Zahl-mal vorkommen

Quantor {Zahl,}

Mindestens Zahl-mal

Quantor {, Zahl}

Maximal Zahl-mal

Quantor {Zahl, Zahl}

Mindestens Zahl-mal, Maximal Zahl-Mal

Besonderheiten bei Quantoren bzw. regulären Ausdrücken

-Reguläre Ausdrücke sind gierig, für ACTTTG gibt CT+ den Treffer CTTT zurücl

- mit einem ? hinter dem Quantor kann man das Verhalten ändern, so dsas CT+2 nur CT als Treffer liefert

Modifizierer bei re.search

- re.DEBUG Debug-Informationen ausgeben

- re.I Groß-und Kleinschreibung ignorieren

- re.M Multi-Zeilen-Treffer

- re.S trifft auch Zeilenumbruch

Menge definieren: set-Objekt

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

- Mengen werden durch set-Objekte dargestellt

- eine Menge kann mit dem Konstrukt {...} definiert werden

- kann unterschiedliche Objekte enthalten

- da die Elemente einer Menge einmalig sein sollen, werden Elemente die mehrmals genannt werden nur ein Mal gezählt

- Objekte müssen unveränderlich sein --> Keine Liste erlaiubt, Tupel und String schon

set-Objekt

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

enthält eine ungeordnete Sammlung von einmaligen unveränderlichen Objekten

Mengen-Casting: Funktion set(...)

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

- so kann man list-Objekte und Zeichenketten in Mengen umwandeln

- bei einem String als Argument liefer set(...) ein set-Objekt zurück, indem die einzelnen Zeichen die Elemente der Menge darstellen

-bei list-Objekten liefert die Funktion ein set-Objekt zurück, dass einmalige und unveränderbare Elemente aus der ursprünglichen Liste enthält

Menge als Liste betrachten

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

- kann mit Hilfe von list(...), str(...), tupel(...) un das jeweilige Objekt gecastet werden

- Listen und Tupel haben dann Menge als Wert (also keine doppelten Sachen)

Methode add bei sets

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

hinzufügen von Elementen in eine Menge (an beliebiger Stelle)

Methode clear(...) bei sets

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

leert die Menge

Methode copy(...) bei sets

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

-liefert eine flache Kopie einer Menge zurück

- da tiefe Elemente unveränderlich sein müssen -> keine Notwendigkeit von deepcopy

Funktion len(...) bei sets

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

Anzahl der Elemente einer Menge

Methode difference(...) bei sets

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

liefert die Differenz zwischen zwei Variablen (zwei sets) zurück

wenn x={1,2,3,4} und y={2,4}, dann gilt: x.difference(y) => {1,3}

Methode difference_update(...) bei sets

Keyboard commands:

= turn,

= for-/backward,

= scroll

wenn die ursprüngliche Menge direkt aktualisiert werden soll

Variable

In einer Variablen kann also ein Wert abgelegt und wieder ausgegeben werden.

Operator minus (-) bei sets

liefert direkt die Mengendifferenz, ohne Methode difference

Methode discard(...) bei sets

- Ein Element kann aus einer Menge entfernt werden

- Falls das Element nicht vorhanden ist, bleibt die Menge unverändert

Methode union(...) bei sets

kann die Vereinigungsmenge zweier Mengen bestimmt werden, hierfür kann man aber auch den Operator gerader Strich verwenden

Methode intersection(..) bei sets

Kann die Schnittmenge zweier Menschen bestimmen , kann auch mit dem Operator & erfolgen

Methode isdisjoint(...) bei sets

kann ermitteln, ob zwei Mengen disjunkt sind, also ihre Schnittmenge leer ist (haben also nicht den gleichen Wert an Menge)

Teilmenge einer Menge

- Mit der Methode issubset(...) kann ermittelt werden, ob eine Menge Teilmenge einer anderen ist

- kann ebenfalls mit <= gemacht werden

Obermenge eine Menge

- Mit der Methode issuperset(...) kann man ermitteln, ob eine Menge eine Obermenge einer anderen ist

- Kann auch mit dem Operator >= erzeugt werden

Methode pop(...) bei sets

-wird ein beliebiges Element einer nicht-leeren Menge zurückgeliefert und entfernt

List-Comprehension: Definition

-kompakte Variante der Listendefinition

- setzt sich zusammen aus:

1. Eingabefolgetyp

2. optionale Abhängigkeit

3. Variable, die die Elemente der Eingabeabfolge repräsentiert

4. ein Zielausdruck, der Elemente in einer Ausgabeliste von Mitgliedern der Eingabefolge erzeugt, die die Abhängigkeit erfüllt

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Flashcards

Quantor ?

Einmal oder Keinmal

Quantor {Zahl}

Muss genau Zahl-mal vorkommen

Quantor {Zahl,}

Mindestens Zahl-mal

Quantor {, Zahl}

Maximal Zahl-mal

Quantor {Zahl, Zahl}

Mindestens Zahl-mal, Maximal Zahl-Mal

Besonderheiten bei Quantoren bzw. regulären Ausdrücken

-Reguläre Ausdrücke sind gierig, für ACTTTG gibt CT+ den Treffer CTTT zurücl

- mit einem ? hinter dem Quantor kann man das Verhalten ändern, so dsas CT+2 nur CT als Treffer liefert

Modifizierer bei re.search

- re.DEBUG Debug-Informationen ausgeben

- re.I Groß-und Kleinschreibung ignorieren

- re.M Multi-Zeilen-Treffer

- re.S trifft auch Zeilenumbruch

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