Bakteriengenetik Scherer

Repressor: Ein Protein welches an den Operator in der DNA bindet und damit die Bindung der RNA-Polymerase an den Promoter blockiert und so die Transkription eines Gens verhindert. Er setzt sich zumeist aus Coreprossor und Aporepressor zusammen.

Corepressor: Molekül welches den Aporepressor aktiviert.

Aprepressor: Protein welches vom Corepressor aktiviert wird und zusammen mit ihm den Repressor formt.

Das CAP Protein bewirkt eine Biegung der DNA um das Protein herum. Unteranderem wird auch die Lokation der RNA Polymerase verändert, was wiederum einen Einfluss auf die Genexpression hat.

Promoter Trapping: 2 verschiedene Operator Bindestellen vorhanden. Schlaufenbildung durch die Interaktion von zwei Repressoren zu einem Polymer. RNA Polymerase ist in der Schlaufe gefangen und kann nicht trankribieren.

Promoter Silencing: Polymerase Zugang zir Bindestelle wird durch einen Repressor blockiert.

Durch die Veränderung der Raumsstruktur z.B durch ein CAP Protein verändert sich auch die Lokation der RNA Polymerase bzw. ihere Bindestelle. Zum Beispiel kann so die Affinität der Polymerase eine Bindung mit der DNA einzugehen erhöht werden.

Hier gibt es 3 verschiedene Bewegungsarten

• Sliding: TF löst sich nicht von der DNA sonder verschiebt sich nur etwas
• Hopping: TF löst sich und bindet sich nach einer kurzen Distanz wieder an die DNA
• Jumping: TF löst sich und springt an einer weiter entfernte Stelle welche durch die "coiled" Struktur der DNA in der Nähe liegt

Der Prozess bei dem ein Genregulator sich von einer Stelle an der er zufällig gebunden ist, zu seiner Bindungstelle am entsprechende Operon bewegt. Durch die "coiled" Form der DNA liegen Stellen die in linearisierter Form weit voneinander entfernt sind, potentiell nah beiander und das Regulator Protein kann leicht zu seiner Bindungstelle springen.

• Plectonemische Supercoils
• Torodiale Supercoils
• Gebogene DNA (curved DNA)

Die unterschiedlichen Konformationen beinflussen die Genregulation. Operons werden außerdem räumlich in den loops gruppiert gemäß ihere Funktion.

Das liegt daran das Operons die Regulatorproteinen herstellen, häufig in unmittelbarer Nähe des Operons liegen, dass die Regulatorproteine regulieren. Es ist also praktisch die Translation direkt an die Transkription anzubinden, sodass die fertigen Regulatorproteine nicht weit diffundieren müssen sondern sich direkt in der Nähe ihrer Bindungstelle befinden. Würde man die Translation wie bei eukaryoten ins Cytoplasma verlagen, so müssten die fertigen Regulatorproteine den ganzen Weg vom Cytoplasma zurück zur Bindungstelle zurücklegen. Dies würde auf Grund des molecular Crowdings zu lange dauern.