Biochemie - Mündliche Prüfung
Vorbereitung auf die mündliche Biochemie-Prüfung im 3. Semester Medizin UZH
Vorbereitung auf die mündliche Biochemie-Prüfung im 3. Semester Medizin UZH
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Cartes-fiches
Was sind Phagen?
· Viren, die Bakterien als Wirtszellen haben
Welche Mutationsarten gibt es?
· Punktmutation
· Deletion
· Insertion
· Inversion
Wozu braucht man PCR?
· Amplifizierung von DNA
· Diagnostik ( finden von Mutationen / ... )
· Forensik
Was ist ein Plasmid?
· zirkuläre, extrachromosomale, doppelsträngige DNA von Bakterien ( und einigen Hefen )
· kann sich unabhängig replizieren
· 1 - 1000 kBp
Wieso sind die kleinen DNA-Fragmente in der Gel-Elektrophorese nicht zu sehen?
· sie sind zu schnell / bereits am Ende angelagt
· es bindet zuwenig Ethidiumbromid an die Fragmente
Was absorbiert bei Hämoglobin?
· Häm-Gruppe
Wie kann Methämoglobin eliminiert werden?
· Methämoglobinreduktase ( benötigt NADH )
· Ascorbinsäure / Glutathion ( nicht-enzymatisch / nur in geringerem Umfang )
Was macht Natriumazid?
· hemmt Katalase ( 2 H2O2 → 2 H2O + O2 / Natriumazid bindet mit N3- an Fe3+ vom Häm der Katalase )
· hemmt Cytochrom c - Oxidase irreversibel ( wie Cyanid und CO )
Wie funktioniert die Katalase?
· H2O2 + Katalase (red) → H2O + Katalase (ox)
· H2O2 + Katalase (ox) → H2O + O2 + Katalase (red)
· Redox-Reaktion / Disproportionierung
Wie kann man die Gesamtmenge an Hämoglobin bestimmen?
· über isosbestische Punkte
· durch Überführen sämtlichen Hämoglobins in Methämoglobin ( mit Kaliumhexacyanoferrat )
Wo kommt Häm sonst noch vor?
· Häm a: Cytochrom c - Oxidase
· Häm b: Cytochrom c - Reduktase / Hämoglobin / Katalase
· Häm c: Cytochrom c
Was gibt es für Detergentien?
· polare Lipide ( z.B. Phospholipide )
· Tenside
· evt. auch Proteine
Was ist eine Bakterien-Kolonie?
· Bakterienfamilie / alle haben das gleiche Genom
Wie lauten die Phasen der Wachstumskurve?
Warum werden flüssige Bakterienkulturen geschüttelt?
· damit die Bakterien nicht sedimentieren ( würde zu O2-Mangel führen )
Warum werden Agarplatten umgekehrt inkubiert?
· damit der kondensierte Wasserdampf nicht heruntertropft
Was ist der Unterschied zwischen Hefen und Bakterien?
· Hefen sind Eukaryoten
· Bakterien sind Prokaryoten
Korreliert die Absorption mit der Wachstumskurve?
· nein, weil die toten Bakterien in Lösung bleiben und dadurch weiter Licht streuen
Warum beginnt man mit der Induktion der Proteinexpression in der log-Phase?
· in dieser Phase vermehren sich die Bakterien am meisten
Wie kann man kontaminierte Platten erkennen?
· Zellkulturen mit unterschiedlichem Aussehen deuten auf Kontamination hin
Was bedeutet
· bakteriostatisch?
· bakteriotoxisch?
· bakteriozid?
· bakteriostatisch: Bakterien sind geschädigt / teilen sich nicht mehr / sind im Wachstum gehemmt
· bakteriotoxisch: Bakterien sterben ab
· bakteriozid: Synonym von bakteriotoxisch
Was bedeutet
· Sterilisation?
· Desinfektion?
· Pasteurisation?
· Sterilisation: Abtöten aller Mikroorganismen
· Desinfektion: deutliche Reduktion der Mikroorganismen
· Pasteurisation: Teilentkeimung ( Abtöten vegetativer Mikroorganismen )
Wie wirken
· Penicillin?
· Ampicillin?
· Kanamycin?
· Penicillin: bakterizid / destabilisiert bei Zellteilung die Zellwand
· Ampicillin: bakterizid / destabilisiert nach Zellteilung die Zellwand ( hemmt Ausbildung der Mureinschicht )
· Kanamycin: bakteriostatisch / lagert sich an die 30S-Untereinheit der Ribosomen
Was bedeutet Multiresistenz?
· Unempfindlichkeit gegen Antibiotika verschiedener Klassen
· Beispiel: MRSA-Stamm ( methicillin resistant staphyloccus aureus )
Sind Proteine von Bakterien identisch mit menschlichen Proteinen?
· nein, weil es keine posttranslationelle Modifikationen gibt
Wie spaltet Chymotrypsin N-Benzoyl-Tyrosinethylester?
· Chymotrypsin spaltet c-terminal von grossen hydrophoben Aminosäuren ( Trp / Tyr / Phe / Met )
· es bildet sich eine Carbonsäure und Ethanol (rot)
· die Spaltung von Estern ist nicht pH-netural ( im Gegensatz zur Spaltung von Peptidbindungen )
· weil aber das Proton die Aminogruppe protonieren würde, wurde eine Schutzgruppe (blau) angehängt
· dadurch kann man eine pH-Änderung nachweisen ( weil die Lösung nur schwach gepuffert ist )
Was spaltet Pepsin?
· nach Phe und Leu
· zwischen unpolaren Aminosäuren
Was spaltet Trypsin?
· nach Aminosäuren mit langen, positiven Seitenketten ( Arg / Lys )
Wie wird Chymotrypsin aktiviert?
· Spaltung zwischen Arg (15) und Ile (16) → π-Chymotrypsin
· Abspaltung von 2 Dipeptiden → α-Chymotrypsin ( 3 Ketten über Disulfidbrücken verbunden )
Warum kann Chymotrypsin auch Ester-Bindungen spalten?
· Ester-Bindungen haben auch ein nukleophiles C-Atom
Welche anderen Proteasen gibt es im Körper?
· Matrixetalloproteasen ( + Zn2+ )
· Cysteinproteasen ( Caspasen mit Cys-His-Diade )
· Asparatproteasen
· Threoninproteasen ( im Proteasom )
· Serinproteasen in der Blutgerinnung:
· II Thrombin
· VII Konvertin
· IX Hämophiliefaktor B
· X Stuart-Prower-Faktor
· XI Hämophiliefaktor C
· XII Hagemann-Faktor
Warum denaturiert Pepsin nicht bei pH 2?
· es hat einen tiefen pI
· es hat saure Aminosäuren im aktiven Zentrum
Was ist das Gegenteil von Hydrolyse?
· Kondensation
Was gibt es für saure Peptidasen?
· Pepsin
· Renin
· heissen saure Peptidasen, weil sie saure AS ( Asp-Asp ) im aktiven Zentrum haben