Mikrobio 11. Interaktionen

• Gemeinsames nutzen einer Nahrungquelle (was alleine nicht möglich wäre)
• Interaktion führt zum Nutzen beider
• Nutzung derselben knappen/begrenzenden Ressource
• Interaktion um das Wachstum des Antagonisten zu hemmen

Problem: Blüte von Filamentösen Bakterien

1. Indentivizieren des Bakteriums (FISH)
2. Herausfinden was es frisst (Radioaktive Isotope)
3. Nahrungskonkurrent finden

Problem: Überflutete Reisfelder sind grosse Quellen für Treibhausgas

1. Beteiligte Mikroben finden
2. Stoffwechselwege kennen (insgesammt exergon, von Energie profitieren beide)
3. Ansprüche an Umwelt (anoxisch, sehr nahe Symbiose)
4. Angepasste Bewirtschaftung (Dünger, Bewässerung)

• Interaktion zweier mutualistischer Bakterien
  • Produzieren gegenseitig Metaboliten welche sie nicht mehr selbstständig produzieren können
  • Auxotroph (brauchen Vit) ≠ Prototroph
• Interaktion gegen patogene Bakterien
  • Ausscheidung von Bacteriocinen (Peptide welche mehr oder weniger spezifisch gegen gewisse Arten gerichtet ist)

• bis 200'000 Zellen pro ml normal
• die wenigsten können auf Agarplatten wachsen
• erkennbar dank Flow cytometrey
• dank vielen kleinen Bakterien alle ökologischen Nieschen besetzt
  • Kein Platz mehr für gefährliche Pathogene

Sequenzieren aller DNA eines Lebensraums (Ozean, Mine, Darm, ARA, Boden)

• Welche Gene sind vorhanden
• Welche möglichen Stoffwechselwege kommen in Frage
• Auf wieviele Mikroben sind die Gene verteilt

=> Symbiosen aufdeken

• Andere Mikrobenzusammensetzung im Darm
• Fettleibige Mäuse: mehr Methanogene Archaeen

=> Mehr Syntrophien, Grössere Energieausbeute, Bessere verwertung der Nahrung

• Mutter zu Kind
  • Geburt
  • Stillen
• Nahrungsgewohnheit
• Menschliche Gene
  • Vergleich von Eineiigen/Zweieiigen Zwilingen