2.1.1.2. Aminosäuren + Proteine

α-Aminosäuren: Die Aminogruppe der α-Aminosäuren befindet sich am zweiten Kohlenstoffatom, einschließlich des Carboxy-Kohlenstoffatoms. Die Zählung beginnt immer mit dem Carboxy-Kohlenstoff, an der die Carboxygruppe (COOH Carbonsäure) hängt. Mit dem Ausdruck Aminosäuren ist oft eine bestimmte Gruppe von α-Aminosäuren gemeint, die hauptsächlich aus L-α-Aminosäuren besteht: die proteinogenen Aminosäuren. Diese sind die Bausteine sämtlicher Proteine allen Lebens auf der Erde und neben den Nukleinsäuren Grundbausteine des Lebens.

Die Kohlenwasserstoff-Seitenketten in dieser Klasse sind unpolar und hydrophob. Die unterschiedlich sperrigen Seitenketten von Alanin, Valin, Leucin und Isoleucin sind für die Ausbildung hydrophober Wechselwirkungen innerhalb der Proteinstrukturen wichtig. 

Glycin besitzt die einfachste Struktur und hat als einzige Aminosäure kein asymmetrisches C-Atom. Der minimale Platzbedarf des Wasserstoff-Atoms von Glycin ermöglicht in Proteinen größere sterische Flexibilität. Glycin findet sich daher oft an Positionen in der Peptidkette, die sich bewegen oder eine Art Gelenk des Proteins darstellen. 

Glycin / Alanin / Valin / Leucin / Isoleucin

Cystein und Methionin 

Sind Aminosäuren welche in ihrer Struktur Schwefel enthalten. Diese AS können so Disulfidbrücken ausbilden. 

Prolin 

Ist eine Iminosäure um genau zu sein,  welche aus einem Pyrrolidinringbesteht und die Carboxygruppe angehängt hat. 

Phenylalanin und Tryptophan 

Alle As enthalten aromatische Ringe in ihrer Molekülstruktur. 

Die dritte jedoch polare aromatische Aminosäure ist Tyrosin. 

Serin, Threonin und Tyrosin 

Diese 3 AS tragen alle eine OH-Gruppe an ihrer Struktur. 

Asparagin und Glutamin tragen zusätzliche  Amino-Gruppen in ihrer Struktur- 

Aspartat und Glutamat liegen bei einem pH von 7.4 immer dissoziiert vor (Proton H ist abgegeben).

Histidin, Lysin und Arginin. Sind basische Aminosäuren, bei denen der pK-Wert so hoch liegt das sie protoniert vorliegen. Bei Histidin ist der pK-Wert bei 6.5 jedoch liegt sie in unseren Zellen teils protoniert vor.